Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Phylogenomics and comparative genomics in mosquitoes |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Phylogenomics and comparative genomics in mosquitoes |
| Campo principale della ricerca | Biological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Zoology |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Activities carried out by the post-doc can be summarized as follow: 1) Collection of genomic data on Aedes albopictus, A. flavopcitus, A. japonicus and A. koreicus, and related mosquito species: genomes collection from NCBI or other databases; collection of SRA data for species lacking assemblies; carry out mapping or sub-assemblies. 2) Building mitochondrial and nuclear genome dataset: get gene annotation for assembled genomes and ortholog search; get BUSCO genes; alignment curation. 3) Running Maximum Likelihood and Bayesian analyses. Building a time-tree; comparison of trees, evolutionary rates and age estimates among different datasets; gene trees/species tree congruence. 4) Comparative analyses of TE families among species. Mapping TE families presence/absence and the relative abundance on the phylogenetic tree of Aedes species; use of comparative phylogenetic methods to analyze TE content variation among species and compare with population data. |
| Descrizione sintetica in inglese | L’attività di ricercae del postdoc può essere riassunta come segue: 1) Raccolta di genomi di Aedes albopictus, A. flavopcitus, A. japonicus and A. koreicus, e zanzare imparentate: raccolta dati da NCBI e altri databse; raccolta dati SRA per specie senza genomi assemblati; mappatura e sub-assembly. 2) Costruzione dataset geni mitocondriali e nucleari; annotazioni geniche per i genomi assemblati, ricerca di ortologhi; isolamento geni BUSCO; cura degli allineamenti. 3) Analisi di Maximum Likelihood and Bayesiane. Costruzione di time-tree; comparazione di alberi, tassi evolutivi e stima delle età tra differenti dataset; congruenza tra albero dei geni e albero delle specie. 4) Genomica comparativa di famiglie di TE tra specie. Mappatura di presenza/assenza e abbondanza relative delle famiglie di TE sull’albero filogenetico di Aedes; utilizzo di metodi filogenetici comparativi per analizzare la variazione del contenuto in TE tra specie e comparazione con i dati di popolazione. |
| Data del bando | 24/10/2023 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE BIOLOGICHE, GEOLOGICHE E AMBIENTALI |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| bigea.nonstrutturati@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 15/11/2023 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |