Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio del fotociclo di aptameri di RNA otticamente modulabili |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational study of photomodulable RNA aptamers. |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | In questo ambito, le "milestones" di cui si occuperà il ricercatore saranno focalizzate sulla costruzione e ottimizzazione di modelli computazionali QM/MM di aptameri e dello studio del meccanismo e dinamica di fotoisomerizzazione usando questi modelli. La ricerca comincerà con la simulazione di aptameri di piccole dimensioni con attività ribozimatica e si concluderà con la produzione di una libreria di modelli con diversa sequenza e diversi cromofori legati covalentemente. |
Descrizione sintetica in inglese | The proposed research activity will be related to the task "Photo-modulable RNA aptamer with therapeutic potential" as part of the above mentioned PNRR CN3 project. The foreseen general deliverables correspond to the design and preparation in the laboratory of an RNA aptamer library based on the reported Were-1 aptamer and incorporating different covalently-linked photo-isomerizable chromophores, located in the aptamer binding pocket. Within such a target, the researcher will be in charge of the construction and optimization of the necessary computational QM/MM models of aptamers and of the simulation of their photoisomerization mechanism and dynamics. The researcher will start by simulating the Were-1 aptamer and, as simpler models, suitable ribozymes and related catalysts and will finish with the production of a model library featuring members with difference aptamer sequence and covalently-bounded chromophores. |
Data del bando | 30/10/2023 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://albo.unisi.it/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Siena |
Sito web | http://www.unisi.it |
amministrazione.dbcf@unisi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 20/11/2023 |
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