Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio dell’impatto di mutazioni del gene TARDP sul metabolismo dell’RNA |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Study on the impact of TARDP gene mutations on RNA metabolism |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’assegnista dovrà occuparsi di 1.Preparazione di RNA da cellule di mammifero per l’analisi del trascrittoma e validazione dei dati bioinformatici mediante RT-PCR sia per quanto riguarda i livelli di splicing alternativo che i livelli di trascritto. 2. Analisi degli effetti della deregolazione trascrizionale e post-trascrizionale di geni specifici sui livelli di proteina e sulla distribuzione subcellulare nel caso di RNA non codificanti 3. Analisi del fenotipo cellulare in termini di effetti della mutazione TARDP oggetto di studio sulla capacità di proliferare, sui principali parametri metabolici della cellula (consumo di ATP, metabolismo lipidico, stress ossidativo) e sulla capacità di rispondere allo stress indotto da danno al DNA. 4. Analisi bioinformatica per individuare le sequenze coinvolte nella regolazione degli eventi di splicing alternativo (SA) deregolati e disegno di ASO per modificare lo SA dell’esone coinvolto. |
Descrizione sintetica in inglese | The research fellow will focus on: - Preparation of RNA from mammalian cells for transcriptome analysis and validation of bioinformatic data by RT-PCR both with regard to alternative splicing and transcript levels. - Analysis of the effects of transcriptional and post-transcriptional deregulation of specific genes on protein levels and subcellular distribution in the case of non-coding RNAs - Analysis of the TARDP mutated cell phenotype in terms of cell proliferation, metabolic parameters (ATP consumption, lipid metabolism, oxidative stress) and DNA damage response. - Bioinformatic analyses to identify the sequences involved in the regulation of the alternative splicing (AS) events deregulated in mutated cells and design of ASO to modify the affected AS events. |
Data del bando | 09/11/2023 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
Italy |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.cnr.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Istituto di Genetica Molecolare Luigi Luca Cavalli Sforza CNR |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Pavia |
Codice postale | 27100 |
Indirizzo | Via Abbiategrasso, 207 |
Sito web | http://www.igm.cnr.it |
alessandra.montecucco@igm.cnr.it | |
Telefono | 0382546351 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 27/11/2023 |
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Come candidarsi | protocollo.igm@pec.cnr.it |