Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Ricostruzione del pangenoma del lupino bianco (Lupinus albus) |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Reconstruction of the white lupin (Lupinus albus) pangenome |
| Campo principale della ricerca | Biological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Biology |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | BIO/18 - GENETICA |
| Descrizione sintetica in italiano | L'addomesticamento è stato un processo mediato dall'uomo, promosso dalla transizione da cacciatori-raccoglitori ad agricoltori nell'Olocene, rimodellando l'architettura fenotipica e genotipica di molte specie. Il lupino bianco (Lupinus albus) è esempio di questo processo di addomesticamento nel Vecchio Mondo, probabilmente avviato dagli antichi greci. Le varianti strutturali sono una fonte emergente di variazione genetica che potrebbe aver facilitato l'adattamento locale delle piante a diversi ambienti, difficili da valutare con i tradizionali approcci WGS. Multipli genomi organizzati in un “pangenome-graph” sono una risorsa per superare questi problemi. Utilizzando genomi ottenuti da diverse accessioni di lupino bianco selvatico/landrace e approcci di sequenziamento e assemblaggio all'avanguardia, ci proponiamo di: creare un grafo del pangenoma che funga da struttura di riferimento adeguata; scoprire un insieme di varianti genomiche in un ampio campione di lupino bianco |
| Descrizione sintetica in inglese | Domestication was a human-mediated process promoted by the transition from hunter-gatherer to farmers in the Holocene that reshaped the phenotypic and genotypic architecture of many species, including animals, plants and bacteria. The white lupin (Lupinus albus) is an example of such a domestication process in the Old World that was probably started by ancient Greeks. Structural variants are an emerging source of genetic variation that may have facilitated the local adaptation of plants to different environments but they are difficult to assess using traditional WGS approaches. Multiple whole-genomes organized in a pangenome graph are a promising resource to overcome these issues. Using whole genomes of several wild/landraces white lupin accessions and state-of-the-art sequencing and assembly approaches, we aim to: i) create a pangenome graph serving as a proper reference structure. ii) discover a comprehensive set of genomic variants in a large sample of white lupins |
| Data del bando | 16/11/2023 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Stanziamento annuale (indicativo) | 19456 |
| Periodicità | 12 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | https://pica.cineca.it/unipd/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Importo annuale | 19456 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Academic |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | https://www.unipd.it/ |
| ricerca.biologia@unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 01/12/2023 - alle ore 00:00 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://pica.cineca.it/ |