Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Design computazionale per la dispersione in acqua di agenti al boro con proteine per BNCT |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational design to disperse in water boron agents with proteins for BNCT |
| Campo principale della ricerca | Chemistry |
| Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
| Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | During the project, annotated database will be create, by downloading their experimental structures from Protein Data Bank (PDB) or predicted by Alpha Fold. Libraries of boron-nanoparticles will be generated ad hoc and QuantumMechanical (QM) calculations will define their parameters (force field). Reverse-docking approaches, based on shape complementarity algorithms, will generate thousands of possible conformations (poses); the best results will undergo Molecular Mechanics (MM) and Molecular Dynamics (MD) simulation refinements. Post-processing analysis will be carried out to evaluate the formation of the complex. The binding affinity of the nanoparticle(s) for the protein(s) will be quantified by Molecular Mechanics-Generalized Born Surface Area (MM-GBSA). Per-residues and pair-wise decomposition analysis will indicate the protein residues responsible for the binding with the nanoparticle. In silico mutations will be performed to enhance the magnitude of the binding affinity |
| Descrizione sintetica in inglese | The project aims to identify protein candidates capable of binding and transporting boron-containing molecules to tumor cells within the context of Boron Neutron Capture Therapy (BNCT), an innovative anti-tumor therapy. Through computational approaches based on Quantum Mechanical (QM), Docking and Molecular Dynamic (MD) simulations, different will be studied as potential carriers capable of dispersing in water and imparting biocompatibility to boron-containing nanoparticles. Among these, 1D and 2D boron nitride systems, carboranes, boranes, and bis-dicarbollides will be investigated. The results of this project will be used for in vitro experiments on cell cultures. |
| Data del bando | 04/03/2024 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://bandi.unibo.it/ricerca/assegni-ricerca |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI CHIMICA "GIACOMO CIAMICIAN" |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| pierpaolo.palmieri@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 18/03/2024 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |