Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Profilo proteomico e analisi meta-proteomica della rizosfera |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Proteomic profiling and meta-proteomic analysis of the rhizosphere |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Botany |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/01 - BOTANICA GENERALE |
Descrizione sintetica in italiano | L’obiettivo della ricerca è ottimizzare protocolli per estrarre proteine da organismi procarioti quali batteri e cianobatteri associati alla rizosfera di semi di Posidonia oceanica. Dovranno, quindi, essere sviluppate tecniche di "meta-proteomica" innovativa per investigare le proteine secrete dalle radici e quelle espresse dal microbiota nella rizosfera durante la formazione delle radici. Per eseguire l'analisi meta-proteomica si dovranno generare proteomi di riferimento ridotti: i peptidi prodotti dalla tripsinizzazione in silico saranno confrontati tra database di sequenze scaricati da diverse specie (microalghe e batteri ristretti a generi marini). Questo database verrà utilizzato per identificare le proteine estratte nei campioni di rizosfera attraverso le analisi in spettrometria di massa. Le proteine verranno classificate per la loro tassonomia, funzioni biologiche e sequenze complete FASTA, e analizzate per domini proteici, motif, folding e struttura. |
Descrizione sintetica in inglese | The objective of the research is to optimize protocols for extracting proteins from prokaryotic organisms such as bacteria and cyanobacteria associated with the rhizosphere of Posidonia oceanica seeds. Therefore, innovative techniques for "meta-proteomics" will need to be developed to investigate proteins secreted by roots and those expressed by the microbiota in rhizosphere layers during root formation. To perform meta-proteomic analysis, the research objective will be to generate reduced reference proteomes: peptides produced by in silico trypsinization will be compared across sequence databases downloaded from different species (microalgae and bacteria restricted to marine genera). This database will be used to identify the proteins extracted from rhizosphere samples through mass spectrometry analysis. Proteins will be classified according to their taxonomy, biological functions, and complete FASTA sequences, and analyzed for protein domains, motifs, folding, and structure. |
Data del bando | 03/04/2024 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 24000 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER |
Sito web del bando | https://unical.portaleamministrazionetrasparente.it/archivio22_bandi-di-concorso_0_20159_874_1.html |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | no |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | La selezione per l'Assegno di Ricerca si basa su titoli e colloquio. La Commissione valuta i candidati fino a un massimo di 70 punti per i titoli e fino a 30 punti per il colloquio. |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The selection for the Research Fellowship is based on qualifications and interview. Committee evaluates candidates for up to a maximum of 70 points for qualifications and up to 30 points for the interview. |
Nome dell'Ente finanziatore | Università della Calabria |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Rende (CS) |
Codice postale | 87036 |
Sito web | https://www.unical.it/ |
silvia.mazzuca@unical.it | |
Telefono | +39 0984 492967 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 23/05/2024 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |