Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Meccanismi di ripiegamento di proteine caratterizzate da complessità topologica |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Unraveling the folding mechanisms of entangled proteins |
Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
S.S.D | FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA |
Descrizione sintetica in italiano | Un terzo del domini proteici contiene motivi topologicamente “intrecciati”, noti come lazo non covalenti, nelle loro strutture native. La presenza di specie proteiche solubili e mal ripiegate, in grado di bypassare il sistema di proteostasi, è stata collegata alle loro proprietà di “intreccio". L'assegnista studierà come la presenza di lazo non covalenti nelle strutture native influenzi la cinetica di ripiegamento, con particolare attenzione al ruolo degli stati intermedi. Tale obiettivo sarà affrontato in diversi contesti (proteine di membrana, ripiegamento cotraslazionale) all'interno di un approccio multiscala, da modelli semplificati su reticolo, a modelli a grana grossa studiati con dinamica di Langevin a dinamica molecolare in solvente esplicito. Saranno disponibili fino a 1000 € all'anno per finanziare le attività di ricerca dell'assegnista. E’ fortemente consigliata la conoscenza preliminare di metodi teorici e soprattutto numerici in biofisica statistica. |
Descrizione sintetica in inglese | One third of protein domains contains entangled topological motifs, known as non-covalent lassos, in their native structures. The presence during/just after protein translation of soluble misfolded proein sub-populations, able to bypass the proteostasis network, was connected with their entanglement properties. The postdoc will study how the presence of non-covalent lasso motifs in native structures affects the folding kinetics, with a focus on the role of kinetic intermediates/metastable states. This general task will be addressed in different contexts (e.g. membrane proteins, cotranslational folding) within a multiscale approach, from toy lattice models to coarse-grained Langevin dynamics to all-atom molecular dynamics. Beside salary, up to 1000 € per year will be available to fund the research activities of the post-doc. Prior knowledge of theoretical and especially numerical methods in statistical biophysics is strongly recommended. |
Data del bando | 03/06/2024 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
International |
Nazionalità dei candidati |
International |
Sito web del bando | http://www.dfa.unipd.it/servizi/amministrazione-trasparente/bandi-di-concorso/bandi-didattica-ricerca-e-altre-tipologie/assegni-di-ricerca/selezioni-aperte-o-in-svolgimento/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 20267 |
Valuta | Euro |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 24 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | la selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico-professionale, della produttività scientifica e di due lettere di presentazione |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | the selection takes plase through the evaluation of the titles, scientific and professional CV, academic/scientific publications and reference letter |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | le domande dei candidati saranno esaminate da una Commissione giudicatrice nominata dal Direttore della struttura e composta da tre membri esperti del settore in cui sarà svolta l'attività di collaborazione, uno dei quali di norma è il Responsabile scientifico |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The applications will be valued by a referre committee, designed by the Director of the structure and composed by three members belongin to the scientific area of the research project, one of them is normally the scientific responsaible of the scientific project |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova - Dipartimento di Fisica e Astronomia |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Padova |
Codice postale | 35131 |
Indirizzo | via F. Marzolo n. 8 |
Sito web | http://www.dfa.unipd.it/servizi/amministrazione-trasparente/bandi-di-concorso/bandi-didattica-ricerca-e-altre-tipologie/assegni-di-ricerca/selezioni-aperte-o-in-svolgimento/ |
segredip@dfa.unipd.it | |
Telefono | +39 0498277115 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 01/07/2024 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | https://pica.cineca.it/unipd/ |