Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Caratterizzazione eco-fisiologica, molecolare e bioinformatica di una collezione di Solanum lycopersicum var. cerasiforme in condizioni di stress salino |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Eco-physiological, molecular and bioinformatic characterization of a Solanum lycopersicum var. cerasiforme genotype collection under salt stress |
Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L'obiettivo della linea di ricerca è l'identificazione della diversità genetica nei loci gst di pomodoro associati alla tolleranza al sale e l'implementazione di strategie di breeding. L'approccio proposto integra l'implementazione di una popolazione di una core collection di riferimento non ridondante di Solanum lycopersicum var. cerasiforme, lo sviluppo di un catalogo di alleli di glutatione S-trnasferasi (gst) mediante arricchimento della sequenza target e sequenziamento di terza generazione a lettura lunga (TGS) e uno studio di associazione che collega varianti strutturali e aplotipi con la tolleranza al sale. Inoltre, la risposta eco-fisiologica della pianta allo stress sarà valutata in fenotipi estremi ottenuti mediante mutagenesi CRISPR/Cas9 di singoli loci gst fenotipizzati mediante piattaforma fenomica. L'analisi trascrittomica comparativa basato su tecnologie NGS permetterà di studiare i meccanismi di regolazione dell'espressione genica alla base della tolleranza al sale. |
Descrizione sintetica in inglese | The main goal of TomResAMed is the identification of genetic diversity in tomato gst loci associated to salt tolerance and its implementation in knowledge-informed breeding strategies. The proposed approach integrates the implementation of a non-redundant reference Solanum lycopersicum var. cerasiforme core collection, the development of a saturating catalogue of glutathione S-trnasferase (gst) alleles (pan-GSTome) by target sequence enrichment and long-read third generation sequencing (TGS) technology, and an association study linking structural variants and haplotypes with salt tolerance and agronomic traits. In addition, the eco-physiological plant response to stress will be assessed in selected most contrasting phenotypes and CRISPR/Cas9 edited mutants for individual gst loci by a High-Throughput Plant Phenotyping platform. A comparative transcriptomic approach by NGS technology will investigate regulative mechanisms controlling the plant response to salt. |
Data del bando | 25/06/2024 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | http://www.unina.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Nome dell'Ente finanziatore | MIUR |
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Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Roma |
Sito web | http://www.miur.gov.it |
antonio.dimatteo@unina.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Other |
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Data di scadenza del bando | 19/07/2024 - alle ore 23:59 |
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Come candidarsi | contrattipersonale.dip.agraria@unina.it |