Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Approcci ‘omici’ per la caratterizzazione dell’interazione fra Lactobacillus crispatus e l’epitelio vaginale |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | ‘Omics’ approaches for the characterization of the interplay between Lactobacillus crispatus and vaginal epithelium |
| G.S.D. | 06/MEDS-03 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
| S.S.D | MEDS-03/A - Microbiologia e microbiologia clinica |
| Descrizione sintetica in italiano | L’assegnista dovrà caratterizzare il profilo trascrizionale di linee cellulari dell'epitelio vaginale co-coltivate con (i) cellule di Lactobacillus crispatus o postbiotici derivati da colture di L. crispatus, (ii) batteri patogeni vaginali e (iii) una combinazione di (i) e (ii). L'RNA verrà estratto dalle colture e quantificato, quindi verrà eseguita la doppia deplezione dell'rRNA e verranno preparate e poi sequenziate le librerie Illumina. L'analisi dei dati verrà eseguita in R per identificare i geni differenzialmente espressi rispetto alla sola coltura cellulare. L'analisi integrativa dei dati mirerà a integrare i dati trascrittomici con dati metabolomici, proteomici e immunologici utilizzando pacchetti R come DamirSeq. |
| Descrizione sintetica in inglese | The researcher will characterize the transcriptional profile of vaginal epithelium cell lines co-cultured with (i) Lactobacillus crispatus cells or postbiotics derived from L. crispatus cultures, (ii) vaginal pathogens, and (iii) a combination of (i) and (ii). RNA will be extracted from the cultures and quantified, then dual rRNA depletion will be performed and Illumina libraries prepared and sequenced. Data analysis will be performed in R to identify differentially expressed genes compared to cell culture alone. Integrative data analysis will aim to integrate transcriptomic data with metabolomic, proteomic and immunologic data using R packages such as DamirSeq |
| Data del bando | 29/07/2024 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://www.unisi.it/servizi-line |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Siena (Fondi MIUR/PNRR) |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Siena |
| Sito web | https://www.unisi.it/ |
| amministrazione.dbm@unisi.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 20/08/2024 - alle ore 00:00 |
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