Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Omics analyses of the metabolic profile and nitroso-proteome of aggressive models of RMS |
| G.S.D. | 05/BIOS-07 - BIOCHIMICA |
| S.S.D | BIOS-07/A - Biochimica |
| Descrizione sintetica in italiano | La S-nitrosilazione (SNO) è coinvolta nella progressione del tumore. In questo progetto vogliamo valutare gli effetti della SNO aberrante nel rabdomiosarcoma (RMS). A tal fine svilupperemo un framework bioinformatico e stimeremo le proteine differenzialmente abbondanti confrontando le condizioni Low vs. High-SNO. Ciò sarà ottenuto integrando metodi per gestire e imputare dati mancanti, passaggi di normalizzazione, elaborazione downstream con riduzione della dimensionalità e modelli lineari generalizzati. Affronteremo anche la complessità delle reti metaboliche nelle cellule di RMS attraverso strumenti bioinformatici avanzati che utilizzano dati di trascrittomica ottenuti nelle diverse cellule RMS analizzate per creare modelli metabolici e identificare un numero di geni, metaboliti e reazioni che sono differenzialmente "attivi". |
| Descrizione sintetica in inglese | S-nitrosylation (SNO) is involved in tumor progression. In this project we want to evaluate the effects of aberrant SNO in rhabdomyosarcoma (RMS). To this end we will develop a bioinformatic framework and estimate differentially abundant proteins comparing Low vs. High-SNO conditions. This will be achieved by integrating methods to handle and impute missing data, normalization steps, downstream processing with dimensionality reduction, and generalized linear models. We will also tackle the complexity of metabolic networks in RMS cells through advanced bioinformatic tools that use transcriptomic data obtained in the different RMS cells analyzed to create metabolic models and identify a number of genes, metabolites, and reactions that are differentially “active”. |
| Data del bando | 20/09/2024 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
OTHER |
| Nazionalità dei candidati |
OTHER |
| Sito web del bando | http://pica.cineca.it |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | università degli studi di roma tor vergata - dipartimento di biologia |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | roma |
| Sito web | https://pica.cineca.it/uniroma2/ |
| assegni.ricerca@amm.uniroma2.it | |
| Telefono | 0672592344 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 05/10/2024 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://pica.cineca.it/uniroma2/ |