Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Metodi algoritmici e combinatori per l’analisi di pangenomi |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Algorithmic and Combinatorial Methods for Pangenome |
G.S.D. | 01/INFO-01 - INFORMATICA |
S.S.D | INFO-01/A - Informatica |
Descrizione sintetica in italiano | L'analisi dei pangenomi, e più in generale lo studio di grandi collezioni di sequenze genomiche altamente ripetitive, segna un punto di svolta che apre la strada a una comprensione più completa della biodiversità genetica. Questo campo di ricerca, che va oltre l'analisi dei singoli genomi per esplorare l'intero spettro della variazione genetica all'interno di una specie, è cruciale per le applicazioni nella medicina di precisione. Intendiamo sviluppare metodi algoritmici e combinatori efficienti per estrarre informazioni e identificare variazioni in grandi collezioni di sequenze genomiche altamente ripetitive. Abbiamo intenzione di definire misure adeguate per valutare la comprimibilità di collezioni di testi altamente ripetitivi. Inoltre, prevediamo di introdurre nuove misure per confrontare strutture combinatorie per l'identificazione di pattern correlati con tratti patogeni e per lo studio dell'evoluzione delle patologie tumorali. |
Descrizione sintetica in inglese | The analysis of pangenomes, and more generally the study of large collections of highly repetitive genomic sequences, marks a turning point that paves the way for a more complete understanding of genetic biodiversity. This field of research, which goes beyond the analysis of individual genomes to explore the entire spectrum of genetic variation within a species, is crucial for applications in precision medicine. We plan to develop efficient algorithmic and combinatorial methods to extract information and identify variations in large collections of highly repetitive genomic sequences. We intend to define adequate measures to assess the compressibility of collections of highly repetitive texts. Moreover, we plan to introduce new measures to compare combinatorial structures for the identification of patterns correlated with pathogenic traits and for studying the evolution of tumor pathologies. |
Data del bando | 17/10/2024 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 26.000 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
Italy EUROPE OTHER |
Nazionalità dei candidati |
OTHER Italy EUROPE |
Sito web del bando | https://www.unipa.it/albo.html |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Importo annuale | 26.000 |
Valuta | Euro |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Palermo |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Palermo |
Codice postale | 90133 |
Indirizzo | Piazza Marina, 61 |
Sito web | https://www.unipa.it/servizi/assegnidiricerca/ |
stefania.crifasi@unipa.it | |
Telefono | 09123893126 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 01/11/2024 - alle ore 00:00 |
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