Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi automatica di big data prodotti da microscopia a fluorescenza a foglio di luce |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Automatic analysis of big data produced by light-sheet fluorescence microscopy |
Campo principale della ricerca | Physics |
Sottocampo della ricerca | Computational physics |
Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
S.S.D | FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA |
Descrizione sintetica in italiano | L’attività di ricerca prevede l’analisi di immagini volumetriche di tessuto cerebrale umano e murino con risoluzione spaziale submicrometrica ottenute con microscopia a fluorescenza a foglio di luce (LSFM). Il/la candidato/a dovrà si occuperà dello sviluppo e messa in opera di metodi per l’elaborazione dei dati ad alte prestazioni di immagini acquisite coi setup sperimentali di microscopia presenti nella Facility Hub di LSFM del LENS. In particolare, si occuperà del postprocessing delle immagini ottenute durante le acquisizioni quali: deconvoluzione, correzione dell’illuminazione, fusione degli stack e allineamento all’atlas di EBRAINS. Inoltre, su queste immagini, il/la candidato/a sarà incaricato/a di sviluppare e applicare tool per l’analisi automatica delle immagini per estrapolare dati quantitativi quali i conteggi delle cellule presenti nel campione studiato. |
Descrizione sintetica in inglese | The research activity involves the analysis of volumetric images of human and mouse brain tissue with submicron spatial resolution obtained using light-sheet fluorescence microscopy (LSFM). The candidate will need to develop high-performance data processing methods for datasets acquired with the experimental microscopy setups available at the LSFM Facility Hub of LENS. Specifically, the candidate will be responsible for the post-processing steps of the image obtained during acquisitions, such as deconvolution, illumination correction, stack fusion, and alignment to the EBRAINS atlas. Additionally, the candidate will be tasked with developing and applying tools for the automatic analysis of these images to extract quantitative data, such as cell counts in the studied samples. |
Data del bando | 18/12/2024 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 25000 |
Periodicità | annuale |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
Sito web del bando | https://lens.unifi.it/amministrazione/albo-online/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 25000 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) |
Curriculum scientifico-professionale idoneo allo svolgimento dell’attività di ricerca oggetto dell’assegno; -Laurea magistrale, specialistica o a ciclo unico in Informatica, Fisica, Matematica, Statistica, Ingegneria |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) |
Scientific-professional curriculum suitable for carrying out the research activity covered by the project; Master Degree in Computer Science or Physics or Statistics or Mathematics or Engineering |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Il concorso è per titoli e per colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | The competition will be carried out by an evaluation of titles and examination, by means of an interview |
Nome dell'Ente finanziatore | LENS |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Firenze |
Sito web | https://lens.unifi.it/ |
segreteria@lens.unifi.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 02/01/2025 - alle ore 23:59 |
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