Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio mediante approcci di |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Study, by high-throughput sequencing approaches, of the transcriptional regulatory networks controlled by the Sox2 transcription factor in neural stem cells |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Biology |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/18 - GENETICA |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto comparerà i networks di espressione genica di cellule staminali neurali (CSN) coltivate dal cervello di topi normali, con CSN da topi in cui abbiamo deleto il gene codificante il fattore trascrizionale Sox2. I trascritti verrano confrontati mediante analisi di RNAseq; in parallelo, effettueremo un confronto mediante ChIA-PET, che identifica le interazioni "long-range" nel genoma (v. Handoko et al., 2011). Basandosi sui risultati di questa analisi (già in parte ottenuti in collaborazione con il Genome Institute of Singapore), ricercheremo, tra le sequenze genomiche oggetto di interazioni "long-range" con geni deregolati nelle cellule delete di Sox2, elementi regolatori direttamente controllati da Sox2, mediante saggi di ChIP e gel shift, e analisi mediante transfezione e transgenesi. |
Descrizione sintetica in inglese | http://www.unimib.it/link/news.jsp?4437000951490490475 The project will compare the gene expression networks of neural stem cells (NSC) cultured from normal mouse developing brain with NSC from mice in which we deleted the gene encoding the Sox2 transcription factor. Transcripts will be compared by RNAseq; in parallel, we will compare long-range interactions within the nucleus, as defined by ChIA-PET (see Handoko et al., Nature Genetics 2011). Based on the results of these studies (already generated in part, in collaboration with the Genome Institute of Singapore), we will seek to identify, among genomic sequences that interact with genes that are de-regulated in Sox2-deleted cells, regulatory elements directly controlled by Sox2, by ChIP, gel shift, transfection and transgenesis approaches. |
Data del bando | 12/09/2012 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.unimib.it/link/news.jsp?4437000951490490475 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
More Experienced researcher or >10 yrs (Senior) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi Milano-Bicocca |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://htt://www.unimib.it |
bandi.assegni_borse@unimib.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 03/10/2012 |
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Come candidarsi | Other |