Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Simulazioni di dinamica molecolare su GPU di un modello coarse-grain di DNA |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular dynamics simulations on GPUs of a coarse-grained realistic DNA model |
| Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
| S.S.D | FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA |
| Descrizione sintetica in italiano | Il modello sviluppato per il DNA da Ouldridge et al. (J. Chem. Phys. 2011) è un modello coarse-grained, top-bottom che descrive gli acidi nucleici ad un livello nucleotide. E’ un modello complicato con sei diversi potenziali non triviali che agiscono tra ciascuno dei tre siti che definiscono un nucleotide. Con simulazioni regolari di dinamica molecolare su un CPUs non è possibile simulare più di un centinaio di nucleotidi; possono essere studiati in questo modo solo sistemi molto piccoli. Con l’aiuto del GPUs, d’altra parte, simulazioni di decine di migliaia di nucleotidi diventano fattibili. Pianifichiamo di simulare quantità di sistemi di acidi nucleici auto assemblati che possono aggregarsi in strutture più larghe come clusters disordinati, network o più regolari strutture di tipo cristallino |
| Descrizione sintetica in inglese | The model developed for DNA by Ouldridge et al. (J. Chem. Phys. 2011) is a coarse-grained, top-bottom model which describes nucleic acids at a nucleotide level. It is a complicated model, with six different non-trivial potentials acting between each of the three sites defining a nucleotide. With regular Molecular Dynamics simulations carried out on CPUs, it is not possible to simulate more than a hundred nucleotides, so that only very small systems can be studied. With the help of GPUs, on the other hand, simulations of tens of thousands of nucleotides become feasible. We plan to simulate bulk systems of self-assembled DNA-constructs made up of single strands that can, in turn, self-assemble into larger structures such as disordered clusters, networks or more regular, crystalline-like structures. |
| Data del bando | 24/09/2012 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Stanziamento annuale (indicativo) | 24073 |
| Periodicità | 1 |
| E' richiesta mobilità internazionale? | no |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://server1.phys.uniroma1.it/physmg/ext/bandipub/main.php |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | no |
| Importo annuale | 24073 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Altri costi in italiano | 9.24% di ritenuta INPS a carico dell’assegnista |
| Altri costi in inglese | share 9.24% of Social Security |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | valutazione di titoli e successivo colloquio da parte della commissione di esame |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | assessment of CV and qualifications and follow-up interviewby the board of examiners |
| Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Fisica Università Sapienza di Roma |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Roma |
| Codice postale | 00185 |
| Indirizzo | piazzale Aldo Moro 5 |
| Sito web | http://www.phys.uniroma1.it/DipWeb/home.html |
| letizia.aprile@uniroma1.it | |
| Telefono | 0033. 06. 49914379 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Ideas-ERC |
|---|
| Data di scadenza del bando | 24/10/2012 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://server1.phys.uniroma1.it/physmg/ext/bandipub/main.php |