Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Approcci molecolari di nuova generazione per l'analisi dell'associazione tra il fungo AM Gigaspora margarita e il suo endobatterio |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Next generation sequencing approaches to investigate an AM fungus, Gigaspora margarita, and its endobacteria |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | I funghi micorrizici arbuscolari (AMF) ospitano nel proprio citoplasma popolazioni di endobatteri. Sulla base del sequenziamento del genoma di Ca. Glomeribacter (Ghignone et al, 2012), il progetto si propone di studiare le basi funzionali della simbiosi tra l'endobatterio e il suo ospite fungino, attraverso metodiche molecolari sia su ampia scala, usando Next Generation Sequencing platforms, sia mirate. La ricerca, della durata proposta di 2 anni, si focalizzerà su 2 punti: 1.Trascrittomica su larga scala del fungo G. margarita con tecniche di NGS (RNA deep sequencing) e Microarray confrontando i profili del fungo wt con una cured line. 2. Analisi molecolare di elementi batterici coinvolti nell’interazione con l’ospite AM. Caratterizzazione di ipotetici “effettori” identificati all'interno del genoma dell'endobatterio tramite esperimenti di doppio ibrido. Caratterizzazione di un sistema di sintesi di composti bioattivi del tipo NRPS/PKS con potenziale azione antibiotica. |
Descrizione sintetica in inglese | Arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) host endobacteria inside their cytoplasm. On the basis of the genome sequencing of Ca. Glomeribacter (Ghignone et al., 2012) the proposal is aimed to investigate some functional basis of the symbiosis between the endobacterium and its fungal host, using a combination of large-scale and targeted approaches. The two-years proposed research will focus on the following points: 1. High throughput transcriptomics of the G. margarita fungus using Next Generation Sequencing techniques (RNA deep sequencing) and Microarray design, comparing the profiles from the wt and the cured line . 2. Molecular analysis of bacterial factors that may play a functional role in the symbiosis with the fungal host by i) characterizing hypothetical "effector-coding genes" in the Ca. Glomeribacter genome with Yeast two-hybrid experiments and ii) genes coding for the NRPS/PKS machinery responsible for the synthesis of bioactive compounds with a potential antibiotic activity. |
Data del bando | 14/11/2012 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Altri costi in italiano | \ |
Altri costi in inglese | \ |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 24 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Il bando e le modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione sono disponibili su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call and how to apply are available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) |
Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Turin |
Sito web | http://www.unito.it/ |
arearicerca-assegni@unito.it | |
Telefono | 0 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 29/11/2012 |
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Come candidarsi | https://loginmiur.cineca.it/ |