Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | CHROMUS Proteine sarcomeriche implicate nella plasticità del muscolo: analisi a livello della cromatina |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | CHROMUSSarcomeric proteins involved in muscle plasticity: an investigation at the chromatin level |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
Descrizione sintetica in italiano | Alcune proteine del disco Z sono associate alla plasticità muscolare, cioè all'abilità dei muscoli di rispondere e adattarsi a particolari condizioni di stress. Negli ultimi anni il nostro gruppo ha scoperto diverse proteine del disco Z implicate in una complessa rete di interazioni. Tra queste ZASP, Telethonin e FATZ che sono responsabili di diverse malattie genetiche muscolari e cardiache. Abbiamo inoltre scoperto che queste proteine interagiscono con Ankrd2 che a sua volta interagisce con diversi fattori di trascrizione ed è localizzata sia nel sarcomero che nel nucleo. Ciò ha portato all'ipotesi che Ankrd2 sia responsabile della trasduzione di segnali di stress dal sarcomero al nucleo. Recentemente abbiamo scoperto che Ankrd2 interagisce anche con proteine coinvolte nella regolazione della struttura cromatinica. Studiare lo stato della cromatina in presenza e in assenza di Ankrd2, mediante ChIP-Seq, RNA-Seq e altre tecnologie innovative. |
Descrizione sintetica in inglese | Several proteins of the Z-disc are associated to muscle plasticity that is the ability of muscle to respond and adapt to particular stress conditions. Over the past years our group has discovered several Z-disc proteins involved in a complex network of interactions. Among these there are ZASP, Telethonin and FATZ which are responsible for different muscular and cardiac genetic diseases. We have also discovered that these proteins interact with Ankrd2 that in turn interacts with several transcription factors and is localized both in the nucleus and in the sarcomere. These observations led to the hypothesis that Ankrd2 may be responsible for the transduction of stress signals from sarcomere to nucleus. Recently we also found that Ankrd2 also interacts with proteins involved in the regulation of chromatin structure. Therefore,with this project we aim to study the chromatin state in presence and absence of Ankrd2, by means of Chip-seq, RNA-seq and other innovative technologies. |
Data del bando | 31/08/2011 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://protocollo.unipd.it/albo/viewer |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Valuta | Euro |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 24 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | L'assegnista dovrà contribuire alla progettazione degli esperimenti ed alla preparazione dei campioni da analizzare. Un ruolo fondamentale dell'assegnista sarà quello di gestire i dati di sequenziamento e i risultati ottenuti dalle analisi bioinformatiche. Si richiedono quindi competenze specifiche sulla gestione e sull'analisi di dati prodotti da sequenziatori di nuova generazione, possibilmente SOLiD. Una competenza generale di bioinformatica è un ulteriore requisito essenziale. |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The postdoc will participate in the design of the experiments and in the preparation of the samples to be analyzed. An essential role of the postdoc will be that of managing the sequencing data as well as the results obtained by the bioinformatic analyses. It is therefore required a specific expertise on managing and analyzing data produced by next generation sequencers, possibly SOLiD. A general competence on bioinformatics is also an essential requisite. |
Nome dell'Ente finanziatore | FONDAZIONE CARIPARO |
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Tipologia dell'Ente | Private with public mission |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | PADOVA |
Sito web | http://www,cribi.it |
cribi@unipd.it | |
Telefono | 390498276281 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 16/09/2011 - alle ore 00:00 |
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