Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi bioinformatica di dati d'espressione di geni e miRNA e di sequenziamento ottenuti all'interno della piattaforma nazionale per lo studio delle neoplasie croniche mieloproliferative |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Bioinformatic analysis of microarray and deep sequencing data for the study of miRNA and gene expression in myeloproliferative diseases |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | L’assegnista svilupperà nuovi metodi e nuovo software, che verranno applicati all’analisi di diversi datasets ottenuti con metodologie su vasta scala e ad alto parallelismo. L’attività dell’assegnista porterà a completamento i due obiettivi principali del progetto. Il primo obiettivo è la caratterizzazione e l’integrazione dei profili d’espressione di miRNA, geni e trascritti, ottenuti con microrray in numerosi campioni da pazienti con diverse malattie mieloproliferative croniche e controlli sani, per la ricostruzione delle reti regolative post-trascrizionali e lo studio delle alterazioni di queste con possibile ruolo patogenetico. Il secondo obiettivo consiste nell’analisi di dati di sequenziamento degli RNA brevi in linee cellulari JAK2 mutate, in campioni di pazienti e controlli sani, per la quantificazione dell’espressione di microRNA noti, la caratterizzazione di isomiRs, e la scoperta di nuovi miRNA altri RNA brevi. |
Descrizione sintetica in inglese | The research fellow will be involved in development of new methods and software. He will also apply to available datasets cutting-edge analytical methods and custom-developed software for data analysis, in the fields of expression profiles and deep sequencing data analysis with integrative genomics and systems biology approaches. The scientific activity will develop according to the two main objectives of the project, namely i. miRNA and miRNA-related RNAs characterization by analysis of short RNAs deep sequencing data and ii. miRNA and target expression profiles integration with target prediction, for regulatory networks reconstruction and analysis |
Data del bando | 13/09/2011 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
Italy |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://dept.bio.unipd.it/main/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 21219 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova - Dipartimento di Biologia |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Padova |
Sito web | http://dept.bio.unipd.it/main/ |
piera.giacon@unipd.it | |
Telefono | 049 827 6235 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 28/09/2011 |
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