Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio computazionale dei meccanismi di permeabilità di membrane batteriche. |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Computational study of permeability mechanisms in bacterial membranes |
Campo principale della ricerca | Physics |
Sottocampo della ricerca | Other |
Settore Concorsuale | 02 - Scienze fisiche |
S.S.D | FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA |
Descrizione sintetica in italiano | La ricerca s’incentrerà sullo studio della permeabilità della membrana dei batteri Gram-Negativi, determinata dall’espressione di porine, ai beta-lattami e a frammenti selezionati. I primi serviranno a capire la resistenza batterica legata alla permeabilità, i secondi a definire nuovi scaffolds con permeabilità migliore. Questo studio richiederà lo sviluppo di algoritmi e schemi di calcolo ibridi, atti a permettere simulazioni su scale temporali lunghe, mantenendo un appropriato livello di accuratezza. Si tratta di metodologie coarse-grained, ibride CG/MM, Monte Carlo/Dinamica Molecolare, Monte Carlo Cinetico. Tale sviluppo richiede conoscenze di meccanica statistica e tecniche computazionali avanzate. Così sarà possibile simulare la traslocazione di vari composti attraverso porine di diverse famiglie batteriche per tempi molto lunghi, permettendo così di identificare possibili determinanti comuni dei meccanismi di traslocazione. |
Descrizione sintetica in inglese | The research will focus on the study of the permeability of the membrane of Gram-Negative bacteria, associated with the expression of porins, to beta-lactams and selected fragments. The first will help in understanding bacterial resistance related to permeability, the latter to define new scaffolds with better permeability. This study will require the development of algorithms and hybrid schemes, able to allow simulations over long time scales, while maintaining an appropriate level of accuracy, such as coarse-grained methods, hybrid CG / MM, Monte Carlo / Molecular Dynamics, Kinetic Monte Carlo. Thus, it will be possible to simulate the translocation of various compounds through porins of different bacterial families for very long times, thus allowing to identify possible determinants common mechanisms of translocation. This development requires knowledge of statistical mechanics and advanced computational techniques. |
Data del bando | 26/02/2013 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://unica2.unica.it/concorsi/index.php?page=assegni |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Nome dell'Ente finanziatore | IMI (Innovative Medicine Initiative) |
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Tipologia dell'Ente | Other |
Paese dell'Ente | OTHER |
Città | Cagliari |
Sito web | http://www.imi.europa.eu/#&panel1-8 |
paolo.ruggerone@dsf.unica.it | |
Telefono | 0039 0706754922 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Other |
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Data di scadenza del bando | 18/03/2013 |
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Come candidarsi | Other |