Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Predizione e analisi basata su reti per la predizione di funzione e folding delle proteine da struttura |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Network-based analysis and prediction of function and folding rates from protein structures |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/10 - BIOCHIMICA |
Descrizione sintetica in italiano | Il candidato lavorerà con metodi computazionali per la bioinformatica strutturale. Le strutture proteiche possono essere rappresentate come reti di interazione tra residui (RIN), considerando i residui come nodi e i lori contatti come archi. Il nostro gruppo ha recentemente pubblicato un servizio web, RING (URL: http://protein.bio.unipd.it/ring/), per costruire RIN in modo interattivo da file PDB per essere visualizzati in Cytoscape. Questo progetto intende estendere RING valutando l’evoluzione delle proteine e le energie di folding, da implementare come plugin per Cytoscape. RIN analizzati con parametri di rete serviranno per identificare le caratteristiche comuni tra questi sistemi complessi. |
Descrizione sintetica in inglese | The applicant will be working on computational methods for structural bioinformatics. Protein structures can be represented as residue interaction networks (RINs), which consider single amino acids in the protein structure as nodes and connections as physico-chemical interactions. Our group has recently published a novel web server, RING (URL: http://protein.bio.unipd.it/ring/), to construct RINs interactively from PDB structure files for visualization in Cytoscape. This project aims to extend the RING service by assessing sequence evolution and folding energetics, to be implemented as Cytoscape plugins. RINs analyzed with the help of network parameters will provide insights into the existence of common characteristics for these complex systems. |
Data del bando | 05/04/2013 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://protocollo.unipd.it/albo/viewer?view=files%2F03926889-000-allegato+0.pdf |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 24 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | La selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico-professionale, della produttività scientifica e di un colloquio |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The selection takes place through the evaluation of the titles, scientific and professional CV, academic/scientific publications and an interview |
Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Biologia - Università degli Studi di Padova |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Padova |
Sito web | http://www.biologia.unipd.it/ |
direbiol2@bio.unipd.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 22/04/2013 |
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Come candidarsi | Other |