Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di una pipeline bioinformatica utile all’analisi dei genomi mediante sequenze NGS |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of a bioinformatic pipeline for genome analyses by means of NGS reads |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
| Descrizione sintetica in italiano | L’avvento delle tecnologie di sequenziamento di nuova generazione ha segnato l’inizio di una era nella produzione dei dati genomici. Questa rivoluzione tecnologica ha notevolmente ridotto il costo del sequenziamento di DNA ed ha reso possibile l’analisi del genoma di un numero sempre maggiore di organismi. Le lunghe sequenze prodotte con la metodologia Sanger sono ora rimpiazzate da centinaia di milioni di “short reads” o “mate-pair reads”. Di conseguenza, le nuove tecnologie di sequenziamento hanno reso più complessa l’archiviazione e l’analisi dei dati di sequenza, nonché l’assemblaggio dei genomi. Lo scopo del progetto è di sfruttare le potenzialità di un tipo di dati di sequenziamento, le sequenze “paired-end”, in modo da sviluppare una pipeline bioinformatica utile alla validazione dell’assemblaggio dei genomi, allo scaffolding dei medesimi e alla identificazione delle variazioni strutturali in progetti di risequenziamento genomico. |
| Descrizione sintetica in inglese | The advent of next generation sequencing technologies has marked the beginning of a new era in the production of genomic data. This still ongoing technological revolution has greatly dropped down the cost of DNA sequencing and made the sequencing of an increasing number of genomes both feasible and cost effective. The Sanger produced long reads are now replaced by hundreds of millions of short reads or pairs of short reads. Accordingly, the new sequencing technologies have complicated the storage and analysis of the sequencing data and the assembly of genomes. The aim of this research project is to exploit a specific type of sequencing data, the paired-end data, in such a way to develop a bioinformatic pipeline useful for genome assembly validation, genome scaffolding and structural variation discovery |
| Data del bando | 24/04/2013 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| E' richiesta mobilità internazionale? | no |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | http://protocollo.unipd.it/albo/viewer?view=files%2F03961559-000-allegato+0.pdf |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
| Importo annuale | 19367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 18 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | La selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico-professionale, della produttività scientifica e di un colloquio |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The selection takes place through the evaluation of the titles, scientific and professional CV, academic/scientific publications and an interview |
| Nome dell'Ente finanziatore | Dipartimento di Biologia - Università degli Studi di Padova |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Padova |
| Sito web | http://www.biologia.unipd.it/ |
| direbiol2@bio.unipd.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 09/05/2013 |
|---|---|
| Come candidarsi | Other |