Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi genomica della specie Solanum melongena |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Genomics of eggplant (Solanum melongena) |
| Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Nell'ambito delle Solanacee, la melanzana (Solanum melongena) è la terza specie più diffusa in coltivazione (FAOstat 43.89Mt, 2010). A dispetto della sua importanza economica la conoscenza dell'organizzazione del suo genoma è poco approfondita. Il DNA genomico della linea 67/3, sarà utilizzato per il sequenziamento del genoma di melanzana (2n=2x=24; ~1.1 Gbp) mediante librerie Illumina (300bp-10kbp) con una copertura finale del genoma pari a 250X. Le sequenze saranno assemblate con SOAPDenovo2, e l’annotazione sarà condotta con Maker. Presso il DISAFA è disponibile una popolazione di mappaggio di 170 RIL, derivanti dall’incrocio tra linee ‘305E40’ e ‘67-3’. Queste verranno genotipizzate mediante l’approccio di ‘Genotyping by sequencing’, per costruire una mappa ultra densa al fine di ancorare il genoma ai 12 gruppi di associazione. Le informazioni genomiche ottenute permetteranno di facilitare le attività di breeding della specie e l'analisi genomica comparativa nelle Solanaceae. |
| Descrizione sintetica in inglese | Eggplant (Solanum melongena L.) belongs to the Solanaceae and is the third most important solanaceous crop in the world (FAOstat 43.89Mt, 2010). Despite the economic importance of eggplant, the knowledge of its genome organization is rather limited compared to that of either tomato or potato. The eggplant nuclear DNA (2n=2x=24, 1.1 Gbp), from the genotype 67-3, will be used to produce a high quality eggplant genome draft, by sequencing Illumina libraries (300bp-10kbp), with a final coverage of 250x. The reads will be assembled using SOAPDenovo2 and the draft will be annotated by Maker. At DISAFA, a 170 RILs population (cross between ‘305E40’ X‘67-3’ lines) is available and will be genotyped through a “Genotyping by sequencing” approach in order to develop a highly saturated map and to anchor the genome to the existing 12 linkage groups. The accumulation of eggplant genomic information will facilitate molecular breeding in eggplant and comparative genomics within Solanaceae. |
| Data del bando | 26/06/2013 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
| Importo annuale | 19367 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
| Comprende il costo della ricerca | yes |
| Altri costi in italiano | \ |
| Altri costi in inglese | \ |
| Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando, modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione e i requisiti sono disponibili su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call, the requirements and how to apply are available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio (il calendario dei colloqui viene pubblicato entro la data di scadenza del bando. I candidati NON riceveranno comunicazione di ammissione al colloquio) |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) - Dates and venues of the interviews are published on the website of the University of Turin at the official notice board (https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/) by the date of the deadline |
| Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Turin |
| Sito web | http://www.unito.it/ |
| arearicerca-assegni@unito.it | |
| Telefono | 0 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
|---|
| Data di scadenza del bando | 16/07/2013 |
|---|---|
| Come candidarsi | https://loginmiur.cineca.it/ |