Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Modellistica molecolare del meccanismo di attivazione del recettore Ah |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular modelling of the Ah receptor activation mechanism |
Campo principale della ricerca | Chemistry |
Sottocampo della ricerca | Computational chemistry |
Settore Concorsuale | 03 - Scienze chimiche |
S.S.D | CHIM/02 - CHIMICA FISICA |
Descrizione sintetica in italiano | l'attività di ricerca si inserisce in un progetto riguardante lo studio del meccanismo di azione biologica del Aryl hydrocarbon Receptor, AhR, i cui leganti a più alta affinità comprendono numerosi contaminanti ambientali. Obiettivo specifico è l'analisi dei meccanismi molecolari attraverso i quali il binding ai leganti stimola la trasformazione di AhR nella forma capace di legare il DNA. In particolare devono essere studiate: le proprietà strutturali e dinamiche del dominio di binding ai leganti di AhR e dei suoi complessi con diversi leganti; le interazioni di AhR con la proteina chaperone hsp90 e la sua dimerizzazione con la proteina ARNT. Per questi obiettivi verranno utilizzati e sviluppati metodi di bioinformatica strutturale, per la prediziona della struttura e delle regioni di interfaccia proteina-proteina, e metodi di modellistica molecolare, quali Dinamica Molecolare e Docking molecolare, per simulare e caratterizzare le proprietà e le interazioni dei domini proteici. |
Descrizione sintetica in inglese | the research activity is part of a project aimed at elucidating the biological mechanism of the Aryl hydrocarbon Receptor, AhR, whose highest affinity ligands include a variety of environmental contaminants. The specific aim is to provide detailed analysis and insights into the molecular mechanisms by which ligand binding stimulates AhR transformation into its DNA binding form. In particular, studies will be addressed to: the structural and dynamic properties of the AhR ligand binding domain and of the receptor in complex with several ligands; the association of AhR with the chaperone hsp90 protein and the dimerization with the ARNT protein. To this end, computational methods will be employed and developed: structural bioinformatics techniques for structure and protein-protein interface prediction; molecular modelling methods, such as Molecular Dynamics and molecular Docking, to simulate and characterize properties and intermolecular interactions of the protein domains. |
Data del bando | 26/07/2013 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.unimib.it/link/news.jsp?6539611472684529382 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) More Experienced researcher or >10 yrs (Senior) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università Bicocca |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://www.unimib.it |
bandi.assegni_borse@unimib.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 26/08/2013 |
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Come candidarsi | Other |