Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo di una mappa di associazione intraspecifica ad alta densità di melanzana (Solanum melongena L.), mediante approccio GBS (Genotyping By Sequencing) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of High-Density Intra-Specific Linkage Map Using Genotyping By Sequencing (GBS) in Eggplant (Solanum melongena L.) |
Settore Concorsuale | 07 - Scienze agrarie e veterinarie |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | La melanzana (Solanum melongena L., 2n=2x=24, genoma 1.1Gbp) è, dopo la patata ed il pomodoro, la Solanacea più diffusa in coltivazione. La produzione mondiale è di 46 Mt (http://faostat.fao.org); l’Italia è il maggior produttore europeo. Abbiamo effettuato il sequenziamento del DNA nucleare di una linea inbred di melanzana (‘67/3’), che è il parentale di una popolazione di mappa costituita da 167 RIL (F6). Librerie Illumina costituite da inserti che variano da 270bp a 10kb sono state sequenziate, consentendo una copertura del genoma di circa 115X, ed il genoma assemblato con SOAPDENOVO 2. Il presente progetto di ricerca prevede il ri-sequenziamento (1x) della popolazione RIL di mappa con l’obiettivo di ancorare ed orientare il genoma. Ciò consentirà di sviluppare una mappa genetica di melanzana ad alta risoluzione, di acquisire nuove conoscenze sull’organizzazione genomica della specie e di sviluppare marcatori molecolari sfruttabili in programmi di selezione assistita. |
Descrizione sintetica in inglese | Eggplant (Solanum melongena L., 2n=2x=24, genome size 1.1Gbp) is the third most important Solanaceous crop after potato and tomato, whose genome sequences are at present available. Its global production is 46 Mt (http://faostat.fao.org); Italy is the largest producer in Europe. We performed the. eggplant nuclear DNA sequencing of the inbred eggplant line ‘67/3’, which is the parent of a RIL mapping population composed of 167 F6 RILs. Size-selected Illumina libraries with different insert sizes (from 270bp to 10kb) were sequenced, producing approximately a 155 coverage, and assembled using SOAPDENOVO 2. In the present research we will perform a low coverage resequencing of the RIL mapping population, with the goal to generate a dense genetic map to anchor and orient the genomic assembly. The results obtained will extend the current knowledge of the genome organization of eggplant, and will produce new tools and markers for accelerating eggplant breeding. |
Data del bando | 15/01/2014 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | yes |
Comprende il costo della ricerca | yes |
Altri costi in italiano | \ |
Altri costi in inglese | \ |
Massima durata dell'assegno (mesi) | 12 |
Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando n. rep 88, modalità di iscrizione/partecipazione alla selezione e i requisiti sono disponibili su https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | The call (rep. n°. 88), the requirements and how to apply are available at the following address: https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/ |
Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | per titoli e colloquio (il calendario dei colloqui viene pubblicato entro la data di scadenza del bando. I candidati NON riceveranno comunicazione di ammissione al colloquio) |
Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | qualifications and interview (in Turin) - Dates and venues of the interviews are published on the website of the University of Turin at the official notice board (https://www.serviziweb.unito.it/albo_ateneo/) by the date of the deadline |
Nome dell'Ente finanziatore | Universita' degli Studi di Torino |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Turin |
Sito web | http://www.unito.it/ |
arearicerca-assegni@unito.it | |
Telefono | 0 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 06/02/2014 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | https://loginmiur.cineca.it/ |