Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | CARATTERIZZAZIONE COMPUTAZIONALE DELLE INTERAZIONI PROTEINA - RNA |
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| Titolo del progetto di ricerca in inglese | COMPUTATIONAL CHARACTERIZATION OF PROTEIN_RNA INTERACTIONS |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE |
| Descrizione sintetica in italiano | Le interazioni tra proteine e RNA stanno ricevendo grandissima attenzione perché centrali in un grande numero di processi cellulari e stati patologici. Nuovi approcci e strumenti computazionali sono necessari per analizzare e razionalizzare i dati sperimentali. Il progetto si prefigge di identificare i determinanti dell'interazione proteina/RNA a livello di struttura primaria, secondaria, terziaria e quaternaria, partendo da interazioni rilevate in esperimenti di CLIP - o RIP-Seq e loro varianti, e da strutture cristallografiche. Metodi saranno sviluppati per: rappresentare e confrontare sequenza e struttura secondaria di RNA; identificare elementi ricorrenti; correlare caratteristiche dell'RNA con quelle della proteina che lo lega; modellare l'interazione tridimensionalmente. Infine, le regole identificate saranno integrate in strumenti predittivi per inferire la possibilità che coppie proteina-RNA non caratterizzate sperimentalmente possano interagire. |
| Descrizione sintetica in inglese | The characterization of the interaction between proteins and RNA is raising a significant interest, given recent evidences ofn their central role in many cellular processes and in pathological states. Novel computational methods and tools are required for the analysis of experimental data. The goal of this project is to identify and model the protein-RNA interaction determinants, at primary, secondary, tertiary e quaternary structure levels, starting froma evidences from high-throughput CLIP-or RIP-Seq datasets, and from crystallographic structures. Novel approaches will be developed for: representing and comparing RNA; the identification of recurrent sequence/structure elements in functionally related RNAs; the identification of protein-RNA interaction determinants; the modelling, up to quaternary structure level, of the interaction. |
| Data del bando | 21/02/2014 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | http://web.uniroma2.it/modules.php?name=Content&action=showpage&content_id=16874§ion_id=4992 |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Roma Tor Vergata - Dipartimento di Biologia |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Roma |
| Sito web | http://www.uniroma2.it |
| assegni.ricerca@uniroma2.it | |
| Telefono | 0672592344 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 13/03/2014 - alle ore 00:00 |
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