Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Studio di microbiomi complessi del tratto gastroenterico |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Study of complex microbiomes from the intestinal tract |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Biodiversity |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/05 - ZOOLOGIA |
Descrizione sintetica in italiano | lo studio della composizione dei microbiomi intestinali è chiave per la comprensione dei meccanismi fondamentali della nutrizione e di molte patologie che non riguardano unicamente il tratto intestinale.Lo scopo del progetto di ricerca è quello di mettere a punto una pipeline bioinformatica per l’analisi della parte biologica dei microbiomi,che permetta la comprensione della composizione in entità biologiche,la comparazione tra microbiomi e l’applicazione di modelli di dinamica.Il candidato dovrà mostrare un’ottima conoscenza delle analisi filogenetiche,della gestione dato sequenziatori Next Generation Sequencing, dell’uso di QIIME,conoscenza di R e dei suoi pacchetti, capacità di programmazione di base in Python e bash,abilità di gestione di grandi moli di dati,gestione database MySQL,interrogazione delle banche dati di riferimento e in generale ottima attitudine nel problem solving.Indispensabile utilizzo piattaforma UNIX. Gradita conoscenza base linguaggio HTML. |
Descrizione sintetica in inglese | http://www.unimib.it/link/news.jsp?2102284362625014303 the study of gut microbiomes is essential to understand fundamental nutritional mechanisms and the implications in different pathologies not only related to the gut tract. The aim of this research project is to implement a bioinformatics pipeline to analyse the microbiomes, with particular attention to the composition in biological entities, the comparison between microbiomes and the ecological modelization. The candidate has to show a perfect knowledge of the phylogenetic reconstructions, managing data deriving from Next Generation Sequencers, the use of QIIME, ability to manage R and its packages, to perform basic Python programming and bash, to manage big data and data mining in the reference databases, to manage database MySQL and in general to demonstrate a very good attitude in problem solving. Essential: use of UNIX platform. Welcomed basic knowledge of HTML language. |
Data del bando | 07/03/2014 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.unimib.it/link/news.jsp?2102284362625014303 |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi Milano-Bicocca |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Milano |
Sito web | http://www.unimib.it |
bandi.assegni_borse@unimib.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 26/03/2014 |
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Come candidarsi | Other |