Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Sviluppo tool ed infrastruttura bioinformatica per l'annotazione di trascrittomi de-novo con particolare riguardo alle specie apprtenenti al fitoplancton. |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Development of bioinformatics tools and infrastructure for the annotation of de-novo transcriptomes with special regard to the species belonging to the phytoplankton group. |
| Campo principale della ricerca | Biological sciences |
| Sottocampo della ricerca | Biology |
| Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | Il progetto di ricerca è incentrato sullo sviluppo ed il perfezionamento di una pipeline bioinformatica per la annotazione dei trascrittomi prodotti de-novo tramite l'utilizzo di tecnologie di nex-generation sequencing. L'istituto ha sequenziato i trascrittomi di circa 20 specie di organismi marini e continuerà a produrne di nuovi, tra cui molte specie di organismi appartenenti al fitoplancton. Questo ha creato le premesse per studi di genomica funzionale e per l’esplorazione in dettaglio delle proprietà metaboliche di molecole di interesse biotecnologico ed ambientale prodotte dai più interessanti organismi marini. Il candidato si occuperà specificamente dell'annotazione di tali trascrittomi e dello sviluppo di un database tool che permetterà l'interrogazione delle annotazioni prodotte da parte dei biologi e della comunità scientifica tutta. Il progetto prevede anche il contributo del candidato alla messa in opera di una infrastruttura bioinformatica che presenterà tali dati |
| Descrizione sintetica in inglese | The research project focuses on the development and the refinement of a bioinformatics pipeline for the annotation of de novo transcriptome produced through the usage of next-generation sequencing technologies. The Institute has sequenced the transcriptomes of about 20 species of marine organisms and will continue to produce new ones, including many species of phytoplanktonic organisms. This has paved the way for functional genomics studies and for exploring in detail the metabolic properties of molecules of biotechnological and environmental interest produced by the most interesting organisms in the marine environment. The candidate will deal specifically with the annotation of such transcriptomes and the development of a database tool allowing querying of records by biologists and the scientific community as a whole. The project will also include the candidate's contribution to the implementation of a bioinformatics infrastructure that will present these data |
| Data del bando | 17/04/2014 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Stanziamento annuale (indicativo) | 21100 |
| E' richiesta mobilità internazionale? | yes |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
All |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | http://www.szn.it |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
|---|---|
| Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
| Importo annuale | 21100 |
| Valuta | Euro |
| Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
| Comprende vitto e spese di viaggio | no |
| Comprende il costo della ricerca | no |
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | Per la partecipazione al concorso i candidati dovranno essere in possesso dei seguenti requisiti: Dottorato di Ricerca in Biologia Computazionale, Bioinformatica, Biotecnologie, Informatica o in discipline attinenti alla bioinformatica, informatica e statistica. E’ necessaria la conoscenza della lingua inglese ed è richiesta conoscenza ed esperienza passata di programmazione e nell'utilizzo di R, Perl, MySQL e applicativi bioinformatici come Blast in ambiente Unix attraverso l'utilizzo della shell. Tali requisiti devono essere posseduti alla data di scadenza del termine utile per la presentazione delle domande di ammissione alla selezione. L’esclusione dalla selezione, per difetto dei requisiti necessari, è disposta con motivato decreto notificato all’interessato. |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | To participate in the competition, candidates must possess the following qualifications: PhD in Computational Biology, Bioinformatics, Biotechnology, Informatics or disciplines related to bioinformatics, informatics and statistics. Knowledge of the English language is required together with past experience in programming and in the usage of R, Perl, MySQL and bioinformatics tools such as Blast in Unix environments using the shell. These requirements must be fulfilled on the date of the deadline for submission of applications for admission to the selection. The exclusion from the selection, for lack of necessary qualifications, shall be introduced by decree notified of motivated. |
| Processo di selezione in italiano (breve descrizione) | Concorso per titoli e colloquio. La valutazione comparativa dei candidati sarà effettuata da un'apposita commissione giudicatrice, che procederà all’esame dei titoli e all’espletamento di un colloquio, teso ad accertare la competenza scientifico-professionale del candidato, nonché la sua attitudine a svolgere la ricerca specifica oggetto della domanda. |
| Processo di selezione in inglese (breve descrizione) | Competitive selection based on qualifications and interview. The assessment of the candidates will be conducted by a committee which will examine the qualifications and the performance in an interview aimed at ascertaining the candidate's professional expertise in the scientific field, as well as his/her attitude to carry out the specific research. |
| Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica Anton Dohrn |
|---|---|
| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | napoli |
| Codice postale | 80121 |
| Indirizzo | villa Comunale |
| Sito web | http://www.szn,it |
| remo.sanges@szn.it | |
| Telefono | +390812533428 |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | Fp7/Other |
|---|
| Data di scadenza del bando | 19/05/2014 |
|---|---|
| Come candidarsi | Other |