Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Whole-transcriptome paired-end sequencing in pancreatic cancer and precursor lesions: from early detection to therapeutic implications |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Whole-transcriptome paired-end sequencing in pancreatic cancer and precursor lesions: from early detection to therapeutic implications |
Campo principale della ricerca | Medical sciences |
Sottocampo della ricerca | Medicine |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | La prognosi dell'adenocarcinoma duttale del pancreas (PDA) rimane ad oggi infausta, per le esigue possibilità terapeutiche. Lo scopo dello studio è quello di effettuare il sequenziamento massivo dell'intero trascrittoma (RNA-Seq) per comprendere meglio la biologia molecolare del PDA. Verranno raccolti 50 frammenti di tessuto, provenienti da PDA o IPMN, raccolti da pezzo operatorio o biopsia. L'analisi verrà effettuata mediante la piattaforma Illumina Hi-ScanSQ. Le sequenze ottenute verranno mappate su un genoma umano di riferimento per evidenziare le varianti a singolo nucleotide (SNVs). I dati saranno validati sul DNA degli stessi campioni, e confrontati con DNA normale da sangue periferico, e nei tumori di tessuti conservati in paraffina. |
Descrizione sintetica in inglese | Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA) is among the most lethal malignancies with a 5-years survival rate of 5%. Objectives: To implemented a whole-transcriptome massively parallel sequencing (RNA-Seq) study to better understand the PDA molecular biology. Methods: 50 tissue fragments from different PDA stages or IPMN, will be collected from specimes or biopsy. RNA-Seq: Illumina paired-end NGS on the Hi-ScanSQ platform (Illumina) analyzes an average of 100 million reads per sample at 75bp read length. Bionformatic analysis was performed. After a systematic filtering procedure, we will select among disease associated and neutral variations in order to prioritize the emerging mutational event Data validation: whole-exome sequencing on the training set of 50 samples on DNA from tumors and on matched normal DNA from peripheral blood, and in tumors from FFPE tissues. |
Data del bando | 16/06/2014 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - CENTRO INTERD.DI RICERCA SUL CANCRO ''GIORGIO PRODI'' |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Bologna |
Sito web | http://www.unibo.it |
ciro.danzo@unibo.it | |
Telefono | +39 051 307532 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 03/07/2014 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |