Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Indicatori microbici marini in aree costiere: un approccio metagenomico (MICGEN) |
---|---|
Titolo del progetto di ricerca in inglese | Marine microbial indicators in coastal areas: a metagenomic approach (MICGEN) |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Il progetto propone un approccio integrato all’identificazione di indici biologici di qualità microbica delle acque, integrando misure di alto profilo tecnologico quali CARD-FISH, citometria a flusso e metatrascrittomica. La metatrascrittomica viene proposta come elemento caratterizzante la funzionalità microbica. Per provare questo approccio, due siti con caratteristiche estreme nel Golfo di Napoli verranno paragonati ed i profili di espressione saranno utilizzati per trovare differenze diagnostiche della reazione delle comunità batteriche alle condizioni ambientali. A causa dell’alto costo di sequenziamento, solo due campioni saranno ottenuti per la trascrittomica, ma le stazioni saranno integrate nello spazio grazie alla complementarietà delle misure di citometria a flusso, per il conteggio totale del comparto microbico, e della CARD_FISH per la composizione in grandi gruppi dei batteri eterotrofi. |
Descrizione sintetica in inglese | The project uses an integrated approach of several up-to-date techniques for the identification of biological indicators of marine water quality. CARD-FISH, flow cytometry and metatranscriptomic profiles will be used in an integrated way to provide a picture of the composition and functioning of the microbes present at two site with very different ecological features. Flow cytometry will be used for total counts of microbes, CARD-FISH for the taxonomical identification of main clades, and metatranscriptomics to provide an insight of their functioning. This is a proof-of-concept project, aiming at comparing two sites with extreme features, one polluted the other pristine, so to relate differences in gene expression to environmental features. Due to the high cost of sequencing, only two samples will be compared, but their representativity in space will be ensured by measurements with the other two techniques |
Data del bando | 05/12/2011 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 19367 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
All |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.szn.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
---|---|
Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica A. Dohrn |
---|---|
Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | Villa Comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
salvatore.orfano@szn.it | |
Telefono | 0815833254 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
---|
Data di scadenza del bando | 04/01/2012 - alle ore 00:00 |
---|---|
Come candidarsi | Other |