Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Meta-trascrittomica di due fasi di un bloom planctonico nel Golfo di Napoli (MCmetagen) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Meta-transcriptomics of a waxing and waning plankton bloom in the Gulf of Naples (MCmetagen) |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Il bloom (fioritura) planctonico costituisce una complessa rete di interazioni all'interno di una comunità di organismi composti da singoli eucarioti unicellulari, batteri, virus e meso-zooplancton. All'interno del progetto Long Term Ecological Research MareChiara, la diversità del plancton viene registrata settimanalmente per individuare i modelli ricorrenti e per monitorare i cambiamenti derivanti dalle variazioni climatiche. In questo progetto si affronteranno principalmente due questioni: "Chi è presente al LTER-MC in due diverse fasi di una fioritura di diatomee?" E "Che cosa stanno facendo in queste diverse fasi?" Per rispondere a tali domande verranno adottate le seguenti strategie. 1. Campionamento su due fasi di una fioritura di plancton. 2. Pyro-sequenziamento e analisi del trascrittoma dei campioni raccolti. Compito principale del candidato sarà lo sviluppo di specifiche pipelines bioinformatiche per analizzare i dati provenienti dai dati di sequenziamento. |
Descrizione sintetica in inglese | A plankton bloom constitutes a complex network of interactions among a rich assemblage of organisms composed of single celled eukaryotes, bacteria, viruses and meso-zooplankton. Within the Long Term Ecological Research project MareChiara, the diversity in the plankton is tracked weekly to uncover changes over seasons and to detect recurrent patterns to monitor changes resulting from climate change. In this project we will address two principal questions: “Who is present over two different phases of a diatom bloom?” and “What are they doing at these different phases?” We address these questions by: 1. Sampling at the two phases of a plankton bloom. 2. Pyro-sequencing and anlyzing the transcriptome of the collected samples. The candidate will mainly have to develop specific bioinformatics pipelines to analyze the data coming from the sequencing data. |
Data del bando | 05/12/2011 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 19367 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
All |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.szn.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zologica Anton Dohrn |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | Villa Comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
salvatore.orfano@szn.it | |
Telefono | +39 0815833254 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 04/01/2012 |
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Come candidarsi | Other |