Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Meccanismi molecolari che controllano la fecondazione di uova di stelle di mare |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Molecular mechanisms controlling fertilization in starfish eggs. |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Questa proposta propone studi di trascrittomica su Astropecten aranciacus, specie mediterranea di stella marina usata per decenni come un modello sperimentale di ricerca in Italia, Francia ed altri paesi. L'uovo di questa specie trasparente e di notevoli dimensioni rappresenta un modello cellulare ideale per studi di microiniezione e imaging. Nonostante i numerosi studi sul ciclo cellulare e la fecondazione utilizzando stelle marine, il DNA, l' RNA e dati di sequenze proteiche non sono ancora disponibili. Questa mancanza di informazioni ostacola il progresso della ricerca soprattutto dal punto di vista molecolare. Pertanto svilupperemo un catalogo completo ed annotato dei trascritti espressi nella uova di A .aranciacus in seguito ad estrazione e sequenziamento dell' RNA ed eseguiremo analisi bioinformatiche sui dati prodotti. Compito principale del candidato sarà lo sviluppo di specifiche pipelines bioinformatiche per analizzare ed annotare i dati provenienti dal sequenziamento. |
Descrizione sintetica in inglese | This research proposal is focused on the initiation of transcriptomic studies on Astropecten aranciacus, the local Mediterranean starfish species that had been used for decades as an experimental animal model in Italy, France, and other European countries. This species provides definitely the best echinoderm egg for microinjection and imaging studies due to its large size and transparency. Despite the epochal studies on cell cycle and fertilization with starfish eggs, the DNA, RNA and protein sequence data are largely missing. This lack of genetic information impeded the research progress in this field. We will create a comprehensively annotated catalogue of transcripts expressed in A. aranciacus eggs by extracting and sequencing RNAs, performing bioinformatics analysis on the data produced and releasing them to the community. The candidate will mainly have to develop specific bioinformatics pipelines to analyze and annotate the sequencing data. |
Data del bando | 05/12/2011 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Stanziamento annuale (indicativo) | 19367 |
E' richiesta mobilità internazionale? | no |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
All |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.szn.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
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Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? | yes |
Importo annuale | 19367 |
Valuta | Euro |
Comprende lo stipendio dell'assegnista | yes |
Comprende vitto e spese di viaggio | no |
Comprende il costo della ricerca | no |
Nome dell'Ente finanziatore | Stazione Zoologica Anton Dohrn |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Napoli |
Codice postale | 80121 |
Indirizzo | Villa Comunale |
Sito web | http://www.szn.it |
salvatore.orfano@szn.it | |
Telefono | +39 0815833254 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 04/01/2012 - alle ore 00:00 |
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Come candidarsi | Other |