Torna ai risultati della ricercaBando per assegno di ricerca
| Titolo del progetto di ricerca in italiano | Differential expression analysis of RNA-Seq Data |
|---|---|
| Titolo del progetto di ricerca in inglese | Differential expression analysis of RNA-Seq Data |
| Campo principale della ricerca | Mathematics |
| Sottocampo della ricerca | Statistics |
| Settore Concorsuale | 13 - Scienze economiche e statistiche |
| S.S.D | - |
| Descrizione sintetica in italiano | L'RNA seq è una tecnica per l'analisi del trascrittoma genetico e consente la misurazione del livello di espressione di un gene (o sotto-porzioni di codice genetico) in condizioni sperimentali diverse. A differenza degli esperimenti microarray, attraverso la nuova tecnologia RNA-seq l'espressione genica viene misurata in termini di conteggio, rendendo quindi necessario nella fase di analisi l’utilizzo di modelli probabilistici per dati discreti, fra cui la distribuzione Binomiale Negativa (BN). Uno degli obiettivi di questi esperimenti è identificare quali geni si esprimano in maniera diversa sotto le condizioni sperimentali osservate. A tal fine la stima del parametro di dispersione della distribuzione BN diventa un passo cruciale, e al contempo delicato, a causa del numero limitato di repliche disponibili. Il progetto di questo assegno di ricerca consiste nel proporre un modello mistura di distribuzioni BN al fine di raggruppare i geni che presentano una variabilità simile. |
| Descrizione sintetica in inglese | The RNA-Seq experiments measure the level of gene expressions under different biological conditions, such as disease types. Typically, these data are discrete values characterized by excess of zeros (unactivated regions) in contrast with very high values when genes are over-expressed. These characteristics can be modelled by the Negative Binomial (NB) distribution. If the aim is to perform statistical testing for differential expression analysis, a potential problem of this distributional choice is the estimation of its dispersion parameter, due to the very few replicates of the RNA-Seq data for each gene. The aim of the project is to develop a mixture model of NB distributions with the aim of clustering genes sharing similar dispersion thus solving the estimation problem. The model will be extended in a generalized linear model framework in order to incorporate temporal covariates, in order to measure the evolution of the gene expressions in correspondence of different conditions. |
| Data del bando | 26/08/2014 |
| Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
All |
| Nazionalità dei candidati |
All |
| Sito web del bando | https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) |
|---|---|
| Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) | il bando e la modulistica per partecipare alla procedura di valutazione comparativa sono disponibili all'indirizzo: https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) | to apply for research grants fill out the form available at the following address: https://www.aric.unibo.it/AssegniRicerca/BandiPubblicati/zz_Bandi_din.aspx |
| Nome dell'Ente finanziatore | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA - - DIPARTIMENTO DI SCIENZE STATISTICHE "PAOLO FORTUNATI" |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Bologna |
| Sito web | http://www.unibo.it |
| cinzia.viroli@unibo.it |
| L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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| Data di scadenza del bando | 19/09/2014 - alle ore 00:00 |
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| Come candidarsi | Other |