Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Lunghi RNA non codificanti nucleari codificati dal gene per il fattore di splicing SRSF1: connessioni con la risposta allo stress nutrizionali |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Nuclear long non-coding RNAs encoded by the gene for splicing factor SRSF1: links with the nutrient stress response |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | - |
Descrizione sintetica in italiano | Lo splicing alternativo è un meccanismo che controlla l'espressione genica. Influenza anche la stabilità dell’RNA introducendo codoni di stop prematuri che dirigono la degradazione del trascritto attraverso la via del non sense mediated RNA decay pathway. I trascritti per il fattore di splicing SRSF1 subiscono una serie di eventi di splicing nel 3'UTR che portano alla produzione di lunghi RNA non codificanti nucleari il cui livello è controllato dallo stress nutrizionale. Ipotizziamo che Is-III possa avere una funzione nella risposta allo stress nutrizionale che si verifica in tumori a causa di deficit di perfusione derivanti dalla rapida crescita del tumore. Il progetto mira ad individuare 1) i trascritti la cui espressione e/o profilo di splicing è controllato da Is-III 2) miRNA che interagiscono con Is-III o RBPs che co-localizzano con Is-III nel nucleo; 3) vie di segnalazione e RBPs che controllano il programma splicing dei trascritti SRSF1. |
Descrizione sintetica in inglese | Alternative splicing (AS) is a potent mechanism to control gene expression. It also affects RNA stability by introducing premature Stop codons that direct transcript degradation through the non-sense mediated RNA decay (NMD) pathway. Transcripts for splicing factor SRSF1 undergo a complex series of splicing events in the 3’UTR that lead to the production of long non-coding (lnc) nuclear RNAs (Is-II, Is-III and Is-IV) whose level is controlled by nutrient stress. We hypothesize that Is-III may have a function in the response to nutrient stress occurring in tumors that suffer perfusion deficits deriving from rapid tumor growth and disorganized vasculature. The project aims at identifying 1) transcripts whose expression and or AS program is controlled by Is-III 2) miRNAs interacting with Is-III or RBPs co-localizing with Is-III in the nucleus; 3) signaling pathways and RBPs controlling the splicing program of SRSF1 transcripts in response to nutrient stress driven by cell density. |
Data del bando | 15/12/2014 |
Numero di assegnazioni per anno | 1 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www.igm.cnr.it |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Nome dell'Ente finanziatore | IGM-CNR |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Pavia |
Codice postale | 27100 |
Indirizzo | Via Abbiategrasso, 207 |
Sito web | http://www.igm.cnr.it |
biamonti@igm.cnr.it | |
Telefono | 0382546322 |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 05/01/2015 |
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Come candidarsi | protocollo.igm@pec.cnr.it |