Bando per assegno di ricerca
Titolo del progetto di ricerca in italiano | “Analisi bioinformatica dei proteomi di p-53 mutante e di Smad4-ubiquination” |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Bioinformatics Analysis of mutant p53 and Smad4-ubiquination proteomes |
Settore Concorsuale | 05 - Scienze biologiche |
S.S.D | BIO/10 - BIOCHIMICA |
Descrizione sintetica in italiano | Il programma di ricerca prevede di identificare proteine isolate sulla base della loro affinità per p-53 wild type o mutante tramite analisi ESI-Q-TOF MS/MS su frammenti triptici utilizzando algoritmi di ricerca basati su database. Verranno confrontati i differenti pattern di migrazione proteomici ottenuti per separazione delle proteine tramite 2D-HPLC, gli allineamenti computazionali dei cromatogrammi e le proteine espresse al di sopra di una soglia prefissata. I risultati di identificazione saranno validati incrociando le risposte di diversi algoritmi di ricerca, mentre la quantificazione delle proteine per l’analisi differenziale sarà effettuata mediante tecniche label-free. |
Descrizione sintetica in inglese | The research program includes the identification of proteins isolated on the basis of their affinity either with wild-type or mutant p-53 by ESI-Q-TOF MS/MS of tryptic fragments, using algorithms based on database search. Different migration proteomic patterns obtained by 2D-HPLC separation of proteins, computational alignments of chromatograms and identification of the proteins differentially expressed proteins will be compared. The identification results will be cross-validated by the consensus among several search algorithms, while quantification of proteins for the differential analysis will be performed using label-free techniques. |
Data del bando | 22/12/2011 |
Paesi in cui può essere condotta la ricerca |
Italy |
Paesi di residenza dei candidati |
All |
Nazionalità dei candidati |
All |
Sito web del bando | http://www-tiresias.bio.unipd.it/Assegni-di-Ricerca.82.0.html |
Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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Nome dell'Ente finanziatore | Università degli Studi di Padova |
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Tipologia dell'Ente | Public research |
Paese dell'Ente | Italy |
Città | Padova |
Sito web | http://www.unipd.it |
fulvio.ursini@unipd.it |
L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | No |
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Data di scadenza del bando | 12/01/2012 |
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Come candidarsi | Other |