Descrizione del bando

Titolo del progetto di ricerca in italiano	Ipometilazione globale del DNA e specifici pattern di mutazione somatica come potenziali biomarcatori di rischio nel carcinoma non a piccole cellule del polmone
Titolo del progetto di ricerca in inglese	DNA global demethylation and specific somatic mutation patterns as potential biomarkers of risk for non small cell lung cancers
Settore Concorsuale	06 - Scienze mediche
S.S.D	MED/08 - ANATOMIA PATOLOGICA
Descrizione sintetica in italiano	L'obiettivo del progetto è quello di indagare i profili genetici ed epigenetici di 183 NSCLC di stadio I al fine di correlarli con la storia clinica del paziente. Lo studio sarà organizzato in tre fasi: 1) analisi con spettrometria di massa associata alla tecnologia “Single Base Extension” di 307 varianti nucleotidiche in 10 geni (EGFR, KRAS, BRAF, PIK3CA, le ANR, ALK, ErbB2, DDR2, MAP2K1 e RET) coinvolti nella tumorigenesi del NSCLC 2) analisi quantitativa della metilazione del DNA mediante pirosequenziamento delle sequenze LINE-1 (Long Interspersed Nucleotide Elements-1) dopo conversione con bisolfito di sodio; 3) analisi integrata dei dati genetici, epigenetici e clinico-patologici relativi a ciascun tumore mediante clustering gerarchico non supervisionato, analisi di associazioni e analisi univariata e multivariata della sopravvivenza.
Descrizione sintetica in inglese	The aim of the project is to investigate the genetic and epigenetic profiles of 183 stage I NSCLCs in order to correlate specific molecular signatures with the clinical history of each patient. The work will be organized into three main tasks: 1) Tumor analysis of 307 nucleotide variants in 10 genes (EGFR, KRAS, BRAF, PIK3CA, NRAS, ALK, ERBB2, DDR2, MAP2K1 e RET). This analysis will be performed using Sequenom iPlex (MALDI-TOF) 2) Methylation of long interspersed nuclear element 1 (LINE-1) will be used as a surrogate marker for global DNA methylation in each tumor. Quantitative methylation analysis will be performed by using bisulfite-PCR and pyrosequencing 3) to identify prognostically significant cluster groups of patients, genetic and epigenetic information will be integrated with the clinico-pathological profile of each tumor, using unsupervised hierarchical clustering, correlation and survival analyses.
Data del bando	05/03/2015
Paesi in cui può essere condotta la ricerca	OTHER
Paesi di residenza dei candidati	OTHER
Nazionalità dei candidati	OTHER
Sito web del bando	http://www4.uninsubria.it/on-line/home/naviga-per-tema/didattica/dipartimenti/articolo2782.html

 

Dettagli dell'assegno di ricerca

Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group)	Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc)

 

Finanziatore

Nome dell'Ente finanziatore	Università degli Studi dell'Insubria
Tipologia dell'Ente	Public research
Paese dell'Ente	Italy
Città	Varese
Sito web	http://www.uninsubria.it

 

Contatto presso l'Ente

E-mail	assegni.borse@uninsubria.it

 

EU Research Framework Programme

L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme?	No

 

Dettagli per la candidatura

Data di scadenza del bando	20/03/2015 - alle ore 00:00