Bando per incarichi post doc
| Titolo del progetto in italiano | Studio della risposta immunitaria indotta dalla vaccinazione mediante approcci multiparametrici di citometria a flusso e analisi trascrittomica |
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| Titolo del progetto in inglese | Study of the immune response induced by vaccination through multiparametric approaches of flow cytometry and transcriptomic analysis |
| G.S.D. | 06/MEDS-03 - MICROBIOLOGIA E MICROBIOLOGIA CLINICA |
| S.S.D | MEDS-03/A - Microbiologia e microbiologia clinica |
| Descrizione sintetica in italiano | attività di analisi dati inerenti la risposta immunitaria indotta dalla vaccinazione in studi clinici, ottenuti mediante analisi citofluorimetrica spettrale multiparametrica e trascrittomica NGS. In particolare, sarà responsabile di condurre tutto il processo delle analisi computazionali dei dati citofluorimetrici, includendo l’ottimizzazione della qualità del campione, la normalizzazione del dato, l’impiego di algoritmi di clustering (FlowSOM, PhenoGraph, ecc.) e tecniche di riduzione della dimensionalità (t-SNE, UMAP, ecc.), e le analisi biostatistiche per un profiling completo di tutte le sottopopolazioni cellulari indotte dalla vaccinazione. L’attività comprenderà anche il processamento dei file FASTQ derivati da esperimenti di trascrittomica e ’analisi dei dati di espressione genica mediante pacchetti dedicati della piattaforma R per l’analisi di espressione differenziale e di arricchimento funzionale (DESeq2, tmod, ecc.). |
| Descrizione sintetica in inglese | analysis activities related to the immune response induced by vaccination in clinical trials, obtained by multiparametric spectral flow cytometric and NGS transcriptomic analysis. In particular, he/she will be responsible for conducting the whole process of computational analysis of flow cytometric data, starting from the optimization of the sample quality, normalization of the data, use of clustering algorithms (FlowSOM, PhenoGraph, etc.) and dimensionality reduction techniques (t-SNE, UMAP, etc.), and biostatistical analysis for profiling the cell subpopulations induced by vaccination. The activity will also include the processing of FASTQ files derived from transcriptomics experiments and the analysis of gene expression data by means of dedicated packages of the R platform for differential expression and functional enrichment analysis (DESeq2, tmod, etc.), with the aim of identifying genes or pathways modulated by vaccination and associated with clinical variables. |
| Data del bando | 10/12/2025 |
| Numero di assegnazioni per anno | 1 |
| Paesi in cui può essere condotto l'incarico |
Italy |
| Paesi di residenza dei candidati |
EUROPE |
| Nazionalità dei candidati |
EUROPE |
| Sito web del bando | https://www.unisi.it |
| Destinatari dell'incarico post doc (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
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| Nome dell'Ente finanziatore | Università di Siena |
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| Tipologia dell'Ente | Public research |
| Paese dell'Ente | Italy |
| Città | Siena |
| Sito web | https://www.unisi.it |
| amministrazione.dbm@unisi.it |
| L'incarico finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? | H2020 |
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| Data di scadenza del bando | 29/12/2025 - alle ore 23:59 |
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