Bando per ricercatore a tempo determinato
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Analisi di dati high-throughput sequencing e generazione di modelli teorici predittivi per RNA codificanti (e non) nell’ambito del neurosviluppo e di patologie quali Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) e DiGeorge syndrome (DGS) |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Analysis of high-throughput sequencing data and generation of predictive theoretical models for coding (and non-coding) RNA in the context of neurodevelopment and diseases like Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and DiGeorge syndrome (DGS) |
Descrizione sintetica in italiano |
Scopo del progetto è la comprensione delle reti di interazione molecolari coinvolte nei processi di sviluppo neurologico, nonché nell'insorgenza e progressione di malattie neurodegenerative, come la Sclerosi Laterale Amiotrofica, e disturbi multisistemici che influenzano l'esito dello sviluppo neurologico, come la sindrome di DiGeorge. Tali reti saranno studiate attraverso approcci computazionali per l’analisi di dati di sequenziamento high-throughput e per la caratterizzazione funzionale di molecole di RNA codificanti e non, con particolare attenzione a lncRNA e circRNA. Le interazioni proteina-RNA, proteina-DNA e RNA-RNA alla base di tali reti saranno ampiamente studiate attraverso l'integrazione di evidenze sperimentali e predizione computazionale. . Il bando è scaricabile dal seguente link: https://web.uniroma1.it/trasparenza/dettaglio_bando_albo/176921 |
Descrizione sintetica in inglese |
The aim of the project is to gain insights into the molecular interaction networks involved in neurodevelopmental processes, as well as in the onset and progression of neurodegenerative diseases, like Amyotrophic Lateral Sclerosis, and multi-system disorders that that influence the neurodevelopmental outcome, like DiGeorge syndrome. Such networks will be studied through computational approaches for the analysis of high-throughput sequencing data and for the functional characterization of coding and non-coding RNA molecules, especially lncRNAs and circRNAs. Protein-RNA, Protein-DNA and RNA-RNA interactions will be extensively investigated through the integration of experimental evidence and computational prediction. You can find the documentation required at: https://web.uniroma1.it/trasparenza/dettaglio_bando_albo/176921 |
Numero posti | 1 |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
Sottocampo della ricerca | Biology |
Settore Concorsuale | 05/E1 - BIOCHIMICA GENERALE |
S.S.D | BIO/10 - BIOCHIMICA |
Destinatari del bando (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
Data del bando | 21/05/2021 |
Research Framework Programme / Marie Curie Actions | H2020/ERC |
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Marie Curie Job Reference Number | 855923 |
Tipo di contratto | Temporary |
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Tempo | Full-time |
Ore settimanali | 36 |
Organizzazione/Ente | Sapienza, Università di Roma |
Paese (dove si svolgerà l'attività) | ITALY |
Città | Roma |
Codice postale | 00185 |
Indirizzo | p.le Aldo Moro, 5 |
Organizzazione/Ente | Sapienza, Università di Roma |
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Tipo | Academic |
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca | Dipartimento di Biologia e Biotecnologie |
Paese | ITALY |
Città | Roma |
concorsi-bbcd@cert.uniroma1.it | |
Sito web | http://bbcd.bio.uniroma1.it/bbcd/ |
Data di scadenza del bando | 20/06/2021 |
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Come candidarsi | concorsi-bbcd@cert.uniroma1.it |
Laurea | PhD or equivalent |
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Ambito della laurea | Biological sciences |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
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Sottocampo della ricerca | Biology |
Anni di esperienza richiesti | 5 |
Lingua | ENGLISH |
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Livello di conoscenza della lingua | Excellent |
Competenze richieste in italiano | Esperienza documentata di analisi dati RNA-Seq, CLIP-Seq e ChIP-Seq prodotti a partire da tecnologie Illumina e possibilmente Nanopore sequencing. - Padronanza delle metodologie in silico per lo studio della struttura e funzione di molecole di RNA non codificanti, specialmente lncRNA e circRNA: allineamento, identificazione di motivi, predizione della struttura secondaria, analisi di conservazione evolutiva, predizione di interazione con proteine ed altri RNA. |
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Competenze richieste in inglese | Documented experience in the analysis of RNA-Seq, CLIP-Seq, ChIP-Seq data produced using Illumina technologies and, possibly, Nanopore sequencing. - Mastery of in silico methodologies for the study of the structure and function of non-coding RNA molecules, especially lncRNAs and circRNAs: alignment, identification of motifs, prediction of the secondary structure, evolutionary conservation analysis, prediction of interaction with proteins and other RNAs. |