Bando per ricercatore a tempo determinato
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Rif. 6552 - All. 11 - Ottimizzazione di algoritmi per l’analisi genomica al fine di ridurre l’impatto ambientale dell’high-performance computing - Area tematica: GREEN |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Rif. 6552 - All. 11 - Optimization of genomic analysis algorithms to decrease environmental footprint of high-performance computing - Thematic area: GREEN |
Descrizione sintetica in italiano | Gli approcci “big data” hanno consentito alla ricerca biologica di raggiungere una nuova risoluzione nella comprensione di fenomeni molecolari, dall’oncologia personalizzata alla metagenomica ambientale. Questi approcci richiedono algoritmi e risorse hardware dedicate di high performance computing, e si stima che la sola analisi dati abbia superato l’1% (>200TWh) della richiesta energetica globale (fonte: IEA). Sotto la supervisione del Prof. Giorgi, che ha una consolidata esperienza nella stesura di algoritmi per la biologia (PMID:27153652, 32232425), l'RTDa migliorerà l’efficienza dell’analisi dati su dataset genomici. Utilizzerà approcci quali la riscrittura in linguaggi di programmazione più efficienti, l’ottimizzazione combinatoria (PMID:27518566), l’utilizzo di GPU, approcci euristici e di artificial intelligence per ridurre la quantità di calcoli effettivi [...]. |
Descrizione sintetica in inglese | Big data approaches allowed biology to reach a new resolution in our understanding of molecular phenomena, from personalized oncology to environmental metagenomics. These approaches require dedicated software and hardware high performance computing resources. It’s estimated (source: International Energy Agency) that roughly currently more than 1% (>200TWh) of global energy demands have been spent by data analysis. The candidate will improve data analysis efficiency for genomics datasets under the supervision of Prof. Giorgi, who brings an established expertise in biological algorithms (PMID:27153652, 32232425). Efficiency approaches will include faster programming languages, combinatorial optimization (PMID:27518566), GPU utilization, heuristic and AI approaches to reduce the total number of effective operations [...]. |
Numero posti | 1 |
Settore Concorsuale | 05/I1 - GENETICA |
S.S.D | BIO/18 - GENETICA |
Destinatari del bando (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
Data del bando | 11/10/2021 |
Research Framework Programme / Marie Curie Actions | No |
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Tipo di contratto | Temporary |
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Tempo | Other |
Organizzazione/Ente | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA |
Paese (dove si svolgerà l'attività) | ITALY |
Città | BOLOGNA |
Organizzazione/Ente | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA |
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Tipo | Academic |
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca | Dipartimento di Farmacia e Biotecnologie - FaBiT |
Paese | ITALY |
Città | BOLOGNA |
apos.ricercatoritempodeterminato@unibo.it | |
Sito web | https://bandi.unibo.it/docenti/rtd |
Data di scadenza del bando | 03/11/2021 - alle ore 23:59 |
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Come candidarsi | https://personale.unibo.it |
Laurea | PhD or equivalent |
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Ambito della laurea | Biological sciences |
Campo principale della ricerca | Biological sciences |
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Sottocampo della ricerca | |
Anni di esperienza richiesti | 3 |
Lingua | ENGLISH |
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Livello di conoscenza della lingua | Good |