Descrizione posizione

Titolo del progetto di ricerca in italiano	Rif. 6552 - All. 63 - Applicazione del sequenziamento massivo come strumento olistico di allerta sulla circolazione di agenti zoonotici noti ed emergenti e sulle fonti di antibiotico resistenza nei sistemi alimentari [...]
Titolo del progetto di ricerca in inglese	Rif. 6552 - All. 63 - Application of high-throughput sequencing as holistic warning system to identify sources and transmission routes of known and emerging zoonotic agents and antibiotic resistance in food systems [...]
Descrizione sintetica in italiano	Si selezioneranno due allevamenti avicoli: uno che utilizza ed uno che non utilizza antibiotici. In ognuno si eseguiranno 3 campionamenti longitudinali di feci, lettiera, aria, acqua e mangime (in allevamento); contenuti ciecali e carcasse (al macello). I campioni verranno sottoposti a metagenomica shotgun (mesi 1-8). Ogni metagenoma verrà analizzato con pipeline bioinformatiche e biostatistiche per determinarne composizione tassonomica e geni di antibiotico resistenza (GAR) (mesi 9-36) al fine di caratterizzare i microbiomi ed i corrispondenti drivers da favorire per anticipare e mitigare la diffusione di agenti patogeni e di GAR. Gli impatti attesi sono: (1) la diffusione di modalità di allevamento più sostenibili dal punto di vista ambientale perché non necessitano di uso di antibiotici e caratterizzate da una ridotta mortalità animale; (2) la valorizzazione della metagenomica come metodologia per la produzione massiva di dati [...].
Descrizione sintetica in inglese	Two poultry farms using and not using antibiotics during the rearing cycle will be identified. In each of them 3 longitudinal samplings will be performed to collect faeces, litter, air, drinking water and feed (in the farm); caeca contents and carcasses (in the slaughterhouse). All samples will be submitted to shotgun metagenomic sequencing (month 1-8). Each metagenome will be processed with bioinformatic and biostatistics pipelines to characterize taxonomic composition and antibiotic resistant genes (GAR) (months 9-36) to map all microbiomes and corresponding drivers to be enhanced to anticipate and mitigate the spreading of pathogenic agents and GAR. The expected impacts are: (1) the implementation of farming strategies more sustainable from an environmental point of view due to the reduced use of antimicrobials and low mortality rate; (2) the valorisation of metagenomics as high throughput methodology for data collection [...].
Numero posti	1
Settore Concorsuale	07/H2 - PATOLOGIA VETERINARIA E ISPEZIONE DEGLI ALIMENTI DI ORIGINE ANIMALE
S.S.D	VET/04 - ISPEZIONE DEGLI ALIMENTI DI ORIGINE ANIMALE
Destinatari del bando (of target group)	Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc)
Data del bando	11/10/2021

 

FP7 / PEOPLE / Marie Curie Actions

Research Framework Programme / Marie Curie Actions	No

 

Dettagli dell'impiego

Tipo di contratto	Temporary
Tempo	Other
Organizzazione/Ente	ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA
Paese (dove si svolgerà l'attività)	ITALY
Città	BOLOGNA

 

Contatto presso l'Organizzazione/Ente

Organizzazione/Ente	ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA
Tipo	Academic
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca	DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE VETERINARIE - DIMEVET
Paese	ITALY
Città	BOLOGNA
E-mail	apos.ricercatoritempodeterminato@unibo.it
Sito web	https://bandi.unibo.it/docenti/rtd

 

Dettagli per la candidatura

Data di scadenza del bando	03/11/2021 - alle ore 23:59
Come candidarsi	https://personale.unibo.it

 

Titoli di studio richiesti

Laurea	PhD or equivalent
Ambito della laurea	Agricultural sciences

 

Esperienze di ricerca richieste

Campo principale della ricerca	Agricultural sciences
Sottocampo della ricerca
Anni di esperienza richiesti	3

 

Lingue richieste

Lingua	ENGLISH
Livello di conoscenza della lingua	Good