Bando per ricercatore a tempo determinato
Titolo del progetto di ricerca in italiano | Rif. 6552 - All. 63 - Applicazione del sequenziamento massivo come strumento olistico di allerta sulla circolazione di agenti zoonotici noti ed emergenti e sulle fonti di antibiotico resistenza nei sistemi alimentari [...] |
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Titolo del progetto di ricerca in inglese | Rif. 6552 - All. 63 - Application of high-throughput sequencing as holistic warning system to identify sources and transmission routes of known and emerging zoonotic agents and antibiotic resistance in food systems [...] |
Descrizione sintetica in italiano | Si selezioneranno due allevamenti avicoli: uno che utilizza ed uno che non utilizza antibiotici. In ognuno si eseguiranno 3 campionamenti longitudinali di feci, lettiera, aria, acqua e mangime (in allevamento); contenuti ciecali e carcasse (al macello). I campioni verranno sottoposti a metagenomica shotgun (mesi 1-8). Ogni metagenoma verrà analizzato con pipeline bioinformatiche e biostatistiche per determinarne composizione tassonomica e geni di antibiotico resistenza (GAR) (mesi 9-36) al fine di caratterizzare i microbiomi ed i corrispondenti drivers da favorire per anticipare e mitigare la diffusione di agenti patogeni e di GAR. Gli impatti attesi sono: (1) la diffusione di modalità di allevamento più sostenibili dal punto di vista ambientale perché non necessitano di uso di antibiotici e caratterizzate da una ridotta mortalità animale; (2) la valorizzazione della metagenomica come metodologia per la produzione massiva di dati [...]. |
Descrizione sintetica in inglese |
Two poultry farms using and not using antibiotics during the rearing cycle will be identified. In each of them 3 longitudinal samplings will be performed to collect faeces, litter, air, drinking water and feed (in the farm); caeca contents and carcasses (in the slaughterhouse). All samples will be submitted to shotgun metagenomic sequencing (month 1-8). Each metagenome will be processed with bioinformatic and biostatistics pipelines to characterize taxonomic composition and antibiotic resistant genes (GAR) (months 9-36) to map all microbiomes and corresponding drivers to be enhanced to anticipate and mitigate the spreading of pathogenic agents and GAR. The expected impacts are: (1) the implementation of farming strategies more sustainable from an environmental point of view due to the reduced use of antimicrobials and low mortality rate; (2) the valorisation of metagenomics as high throughput methodology for data collection [...]. |
Numero posti | 1 |
Settore Concorsuale | 07/H2 - PATOLOGIA VETERINARIA E ISPEZIONE DEGLI ALIMENTI DI ORIGINE ANIMALE |
S.S.D | VET/04 - ISPEZIONE DEGLI ALIMENTI DI ORIGINE ANIMALE |
Destinatari del bando (of target group) |
Experienced researcher or 4-10 yrs (Post-Doc) |
Data del bando | 11/10/2021 |
Research Framework Programme / Marie Curie Actions | No |
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Tipo di contratto | Temporary |
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Tempo | Other |
Organizzazione/Ente | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA |
Paese (dove si svolgerà l'attività) | ITALY |
Città | BOLOGNA |
Organizzazione/Ente | ALMA MATER STUDIORUM - UNIVERSITA' DI BOLOGNA |
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Tipo | Academic |
Facoltà/Dipartimento/Laboratorio di ricerca | DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICHE VETERINARIE - DIMEVET |
Paese | ITALY |
Città | BOLOGNA |
apos.ricercatoritempodeterminato@unibo.it | |
Sito web | https://bandi.unibo.it/docenti/rtd |
Data di scadenza del bando | 03/11/2021 |
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Come candidarsi | https://personale.unibo.it |
Laurea | PhD or equivalent |
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Ambito della laurea | Agricultural sciences |
Campo principale della ricerca | Agricultural sciences |
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Sottocampo della ricerca | |
Anni di esperienza richiesti | 3 |
Lingua | ENGLISH |
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Livello di conoscenza della lingua | Good |